More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4776 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  54.28 
 
 
776 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  58.1 
 
 
741 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  52.03 
 
 
763 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  54.36 
 
 
720 aa  771    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  57.86 
 
 
734 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  59.17 
 
 
712 aa  773    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  51.8 
 
 
770 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  57.74 
 
 
739 aa  771    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  58.74 
 
 
734 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
727 aa  1456    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  74.32 
 
 
714 aa  1046    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  96.29 
 
 
728 aa  1372    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  57.51 
 
 
735 aa  763    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  52.66 
 
 
750 aa  651    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  62.99 
 
 
757 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  57.93 
 
 
720 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  60.79 
 
 
732 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  53.24 
 
 
779 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  73.08 
 
 
714 aa  1025    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  51.32 
 
 
723 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  99.31 
 
 
727 aa  1444    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  52.38 
 
 
833 aa  658    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  54.1 
 
 
730 aa  641    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  76.09 
 
 
728 aa  1090    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  48.33 
 
 
775 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  49.66 
 
 
651 aa  528  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  46.56 
 
 
654 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  46.92 
 
 
669 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  47.36 
 
 
796 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  44.44 
 
 
718 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  45.67 
 
 
691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  42.69 
 
 
724 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  44.46 
 
 
714 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  41.72 
 
 
718 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  42.33 
 
 
764 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  42.76 
 
 
759 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  43.44 
 
 
757 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  44.99 
 
 
744 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  41.43 
 
 
784 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  41.43 
 
 
765 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  42.25 
 
 
760 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  43.55 
 
 
760 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  42.73 
 
 
759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  45.31 
 
 
656 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  40.7 
 
 
724 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  42.62 
 
 
831 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  41.23 
 
 
768 aa  452  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  42.04 
 
 
742 aa  452  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  43.03 
 
 
769 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  41.76 
 
 
712 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  42.93 
 
 
750 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  42.39 
 
 
758 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  46.56 
 
 
810 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  42.03 
 
 
788 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  42.79 
 
 
707 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  46.02 
 
 
830 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  46.19 
 
 
830 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  45.77 
 
 
815 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  43.12 
 
 
735 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  43.26 
 
 
729 aa  442  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  42.55 
 
 
788 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  41.68 
 
 
743 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  41.7 
 
 
733 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  46.24 
 
 
814 aa  429  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  41.64 
 
 
732 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40.93 
 
 
712 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  43.44 
 
 
658 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  44.32 
 
 
728 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  44.83 
 
 
750 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  40.91 
 
 
709 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  43.96 
 
 
736 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  42.17 
 
 
712 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.93 
 
 
776 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  44.6 
 
 
626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  43.29 
 
 
727 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  38.23 
 
 
648 aa  399  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  43.38 
 
 
763 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  42.76 
 
 
776 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  42.29 
 
 
618 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  43.65 
 
 
626 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  40.37 
 
 
744 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  40.42 
 
 
643 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.87 
 
 
751 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  39.68 
 
 
654 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  41.03 
 
 
765 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  42.54 
 
 
699 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  39.53 
 
 
811 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  41.79 
 
 
824 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.12 
 
 
755 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 
643 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 
643 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  41.55 
 
 
761 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  41.43 
 
 
824 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 
626 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 
683 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  41.79 
 
 
640 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  40.71 
 
 
625 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.13 
 
 
661 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.03 
 
 
648 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 
727 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>