More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0432 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1846  penicillin-binding protein 1B  51.79 
 
 
807 aa  779    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0159  penicillin-binding protein 1B, putative  53.6 
 
 
765 aa  805    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0432  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
812 aa  1650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0438  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.76 
 
 
942 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00387795  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  36.51 
 
 
918 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  35.7 
 
 
916 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  31.02 
 
 
829 aa  233  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  30.48 
 
 
934 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.7 
 
 
743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.74 
 
 
640 aa  207  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  30.26 
 
 
625 aa  207  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.45 
 
 
685 aa  207  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  30.29 
 
 
824 aa  203  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  28.63 
 
 
861 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  28.75 
 
 
837 aa  201  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  29.77 
 
 
775 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  29.05 
 
 
830 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  30.72 
 
 
640 aa  198  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  28.47 
 
 
837 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  29.38 
 
 
814 aa  197  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 
765 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  28.13 
 
 
836 aa  193  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  28.71 
 
 
820 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  29.78 
 
 
643 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  29.78 
 
 
643 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  28.08 
 
 
843 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  28.06 
 
 
835 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  29.78 
 
 
683 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  28.02 
 
 
830 aa  191  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  28.19 
 
 
834 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  29.7 
 
 
727 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  28.06 
 
 
834 aa  191  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  27.64 
 
 
820 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.37 
 
 
618 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  29.26 
 
 
721 aa  189  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  27.78 
 
 
846 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  27.78 
 
 
832 aa  187  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  26.93 
 
 
778 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  28.86 
 
 
897 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  29.92 
 
 
773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  29.73 
 
 
641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  28.51 
 
 
905 aa  185  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  27.69 
 
 
980 aa  184  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  28.35 
 
 
896 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  28.35 
 
 
897 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  28.35 
 
 
897 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  28.35 
 
 
897 aa  183  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  28.35 
 
 
900 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  28.57 
 
 
647 aa  183  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  25.56 
 
 
778 aa  183  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  27.75 
 
 
654 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  28.69 
 
 
712 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  27.5 
 
 
839 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  28.59 
 
 
676 aa  182  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 
643 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  28.17 
 
 
897 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  27.82 
 
 
941 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  26.4 
 
 
638 aa  180  8e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  30.72 
 
 
680 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  29.31 
 
 
746 aa  180  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  27.67 
 
 
720 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1294  transglycosylase domain-containing protein  34.84 
 
 
301 aa  179  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  30.73 
 
 
667 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  28.81 
 
 
761 aa  179  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  28.77 
 
 
683 aa  178  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  30.54 
 
 
680 aa  177  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  28.92 
 
 
683 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  27.68 
 
 
794 aa  177  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 
795 aa  177  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  29.28 
 
 
683 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  27.6 
 
 
865 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  29.1 
 
 
683 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  28.53 
 
 
860 aa  177  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.94 
 
 
879 aa  177  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  29.62 
 
 
746 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  28.05 
 
 
643 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  30.54 
 
 
673 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  29.1 
 
 
683 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.81 
 
 
683 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.59 
 
 
796 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  30.54 
 
 
673 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  29.1 
 
 
683 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  28.86 
 
 
681 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  28.05 
 
 
643 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 
683 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  30.54 
 
 
680 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  30.37 
 
 
680 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  27.26 
 
 
642 aa  174  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  29.67 
 
 
679 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  28.26 
 
 
643 aa  174  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  26.74 
 
 
766 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  29.05 
 
 
679 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1785  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
301 aa  174  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1820  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
301 aa  174  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  28.12 
 
 
727 aa  173  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  29.62 
 
 
705 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  28.4 
 
 
824 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  28.42 
 
 
765 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  28.8 
 
 
683 aa  173  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  28 
 
 
648 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>