More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0159 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0159  penicillin-binding protein 1B, putative  100 
 
 
765 aa  1566    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0432  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  53.2 
 
 
812 aa  767    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1846  penicillin-binding protein 1B  61.23 
 
 
807 aa  951    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0438  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.94 
 
 
942 aa  457  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00387795  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  35.75 
 
 
916 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  35.89 
 
 
918 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29 
 
 
765 aa  212  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  29.92 
 
 
934 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.31 
 
 
743 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  28.26 
 
 
773 aa  197  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  27.74 
 
 
775 aa  197  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  27.88 
 
 
941 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  26.22 
 
 
814 aa  194  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.89 
 
 
687 aa  192  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  28.04 
 
 
829 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  26.46 
 
 
843 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  27.05 
 
 
642 aa  187  7e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  27.63 
 
 
645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  27.6 
 
 
640 aa  185  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  28.15 
 
 
625 aa  185  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  28.55 
 
 
676 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  26.99 
 
 
618 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  28.48 
 
 
705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  26.94 
 
 
727 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  26.66 
 
 
640 aa  184  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  28.62 
 
 
642 aa  184  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1785  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
301 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1820  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
301 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  27.55 
 
 
837 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  28.32 
 
 
705 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  28.32 
 
 
705 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  28.35 
 
 
912 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  27.44 
 
 
727 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  28.74 
 
 
901 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  28.32 
 
 
705 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  28.99 
 
 
649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  28.52 
 
 
643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  28.52 
 
 
643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  28.32 
 
 
705 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  28.32 
 
 
705 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  28.4 
 
 
680 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  29.07 
 
 
705 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.08 
 
 
905 aa  181  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  28.01 
 
 
746 aa  180  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  28.07 
 
 
705 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  28.4 
 
 
667 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  28.4 
 
 
680 aa  180  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.67 
 
 
661 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  28.76 
 
 
746 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  29.07 
 
 
705 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  28.49 
 
 
721 aa  178  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  25.92 
 
 
638 aa  178  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  27.57 
 
 
837 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  28.35 
 
 
830 aa  178  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  28.4 
 
 
680 aa  178  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  27.3 
 
 
654 aa  178  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  28.57 
 
 
680 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  27.2 
 
 
834 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  27.12 
 
 
836 aa  177  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  28.4 
 
 
673 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  28.57 
 
 
680 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  28.4 
 
 
673 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  27.14 
 
 
820 aa  177  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  27.71 
 
 
679 aa  177  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  27.24 
 
 
834 aa  177  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  25.71 
 
 
776 aa  177  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  28.4 
 
 
680 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  27.17 
 
 
835 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  27.05 
 
 
820 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  27.29 
 
 
681 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  29.04 
 
 
723 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  28.19 
 
 
832 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  25.97 
 
 
795 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  27.47 
 
 
706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  27.05 
 
 
846 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  26.13 
 
 
683 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  26.45 
 
 
828 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  27.08 
 
 
824 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  27.63 
 
 
679 aa  174  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  28.28 
 
 
865 aa  174  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  27.05 
 
 
641 aa  174  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  25.04 
 
 
644 aa  174  6.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  29.88 
 
 
897 aa  173  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  27.27 
 
 
708 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  29.76 
 
 
897 aa  173  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  27.18 
 
 
830 aa  173  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  26.86 
 
 
778 aa  173  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.34 
 
 
791 aa  173  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  29.71 
 
 
896 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  29.71 
 
 
897 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  29.71 
 
 
897 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  29.71 
 
 
897 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  26.13 
 
 
880 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  29.71 
 
 
900 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  29.41 
 
 
905 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  26.93 
 
 
824 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  26.38 
 
 
761 aa  171  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  29.27 
 
 
709 aa  171  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  27.34 
 
 
683 aa  171  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  26.27 
 
 
766 aa  171  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>