More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0900 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  56.91 
 
 
686 aa  692    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
687 aa  1408    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  50.45 
 
 
721 aa  655    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.51 
 
 
685 aa  538  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  43.3 
 
 
775 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  39.77 
 
 
773 aa  486  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  44.61 
 
 
743 aa  472  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  36.79 
 
 
680 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  39.53 
 
 
706 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  37.88 
 
 
680 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  37.78 
 
 
679 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
679 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  37.54 
 
 
673 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  37.54 
 
 
680 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  37.54 
 
 
680 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  37.54 
 
 
673 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  37.71 
 
 
680 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  37.54 
 
 
680 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  37.54 
 
 
667 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  40.86 
 
 
905 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.79 
 
 
761 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.65 
 
 
705 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 
765 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  37.12 
 
 
795 aa  340  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  37.07 
 
 
705 aa  336  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  36.72 
 
 
705 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  37.07 
 
 
705 aa  336  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  36.9 
 
 
705 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  37.07 
 
 
705 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  36.9 
 
 
705 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  36.7 
 
 
746 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  36.6 
 
 
705 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  36.9 
 
 
705 aa  333  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 
746 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.2 
 
 
880 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 
709 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
727 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  34.94 
 
 
912 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 
727 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.95 
 
 
806 aa  303  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 
794 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  33.78 
 
 
832 aa  296  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 
828 aa  294  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0346  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 
863 aa  293  7e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  34.61 
 
 
820 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  34.05 
 
 
834 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  34.6 
 
 
846 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  34.6 
 
 
834 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  33.88 
 
 
835 aa  291  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  33.78 
 
 
830 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  33.72 
 
 
837 aa  287  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  34.92 
 
 
901 aa  286  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.72 
 
 
661 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 
836 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 
839 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  33.11 
 
 
837 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 
691 aa  277  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.34 
 
 
648 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  32.57 
 
 
843 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  31.18 
 
 
708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.7 
 
 
751 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  31.31 
 
 
814 aa  275  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 
625 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.55 
 
 
683 aa  273  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.98 
 
 
618 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  33.62 
 
 
720 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.65 
 
 
649 aa  267  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.06 
 
 
643 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.06 
 
 
643 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.36 
 
 
654 aa  266  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.68 
 
 
681 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.45 
 
 
640 aa  260  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 
914 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  32.2 
 
 
775 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  31.28 
 
 
704 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
865 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 
683 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 
648 aa  258  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.39 
 
 
640 aa  257  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.94 
 
 
735 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.77 
 
 
642 aa  256  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.5 
 
 
739 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 
643 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  34.32 
 
 
683 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  33.44 
 
 
757 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  32.11 
 
 
647 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  31.98 
 
 
729 aa  254  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  31.92 
 
 
642 aa  253  7e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.14 
 
 
683 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  34.14 
 
 
683 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  33.76 
 
 
693 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.33 
 
 
734 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.95 
 
 
683 aa  252  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 
829 aa  252  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  32.48 
 
 
744 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.95 
 
 
683 aa  252  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.89 
 
 
779 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  32.49 
 
 
646 aa  250  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.77 
 
 
683 aa  250  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.11 
 
 
791 aa  250  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>