More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2410 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  50.86 
 
 		 773 aa  721    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  54.4 
 
 		 775 aa  723    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 743 aa  1521    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  43.89 
 
 		 721 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  44.9 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.33 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  44.79 
 
 		 687 aa  465  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  36.55 
 
 		 680 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  37.87 
 
 		 680 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  38.49 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  36.92 
 
 		 679 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  38.31 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  38.14 
 
 		 680 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  38.31 
 
 		 680 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  38.14 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  38.14 
 
 		 673 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  38.14 
 
 		 673 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  37 
 
 		 679 aa  366  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  38.16 
 
 		 905 aa  336  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.46 
 
 		 765 aa  327  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.68 
 
 		 761 aa  316  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 705 aa  312  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  33.86 
 
 		 880 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  34.56 
 
 		 746 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  35.09 
 
 		 705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  35.09 
 
 		 705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  35.09 
 
 		 705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  34.93 
 
 		 705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  34.76 
 
 		 705 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  34.76 
 
 		 705 aa  303  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 		 795 aa  303  9e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  34.43 
 
 		 705 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  34.65 
 
 		 705 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 727 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 746 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 829 aa  290  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  34.86 
 
 		 676 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.74 
 
 		 709 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 901 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.24 
 
 		 828 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  34.28 
 
 		 727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  35.61 
 
 		 836 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 		 912 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  34.75 
 
 		 905 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 900 aa  283  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 896 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 897 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 897 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 897 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 897 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  34.94 
 
 		 834 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  34.84 
 
 		 830 aa  279  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.27 
 
 		 806 aa  278  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  34.78 
 
 		 820 aa  277  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  34.68 
 
 		 832 aa  277  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  34.78 
 
 		 846 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  34.66 
 
 		 835 aa  276  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  34.44 
 
 		 839 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  34.55 
 
 		 834 aa  275  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  34.4 
 
 		 794 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 754 aa  274  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  33.62 
 
 		 865 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  33.5 
 
 		 647 aa  272  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  33.64 
 
 		 665 aa  269  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 914 aa  270  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 		 814 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  34.18 
 
 		 897 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  34.39 
 
 		 837 aa  269  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  34.09 
 
 		 837 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.55 
 
 		 679 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  31.79 
 
 		 708 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  36.87 
 
 		 656 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  32.54 
 
 		 734 aa  264  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.08 
 
 		 720 aa  264  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  32.4 
 
 		 732 aa  263  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.62 
 
 		 744 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 727 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 727 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.63 
 
 		 681 aa  261  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.09 
 
 		 739 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.56 
 
 		 761 aa  260  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  31.34 
 
 		 843 aa  260  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.36 
 
 		 648 aa  260  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 683 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 683 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2706  glycosyl transferase family 51  32.64 
 
 		 728 aa  259  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488127  normal  0.218116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 		 701 aa  259  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 704 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.22 
 
 		 827 aa  258  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.81 
 
 		 618 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.69 
 
 		 640 aa  258  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 683 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 683 aa  257  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 683 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 775 aa  257  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.68 
 
 		 662 aa  257  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  31.93 
 
 		 683 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>