More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3225 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  49.52 
 
 
855 aa  768    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  46.68 
 
 
801 aa  692    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
952 aa  1947    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  49.33 
 
 
861 aa  748    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  45.44 
 
 
853 aa  562  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  46.07 
 
 
860 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  45.99 
 
 
980 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 
927 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 
908 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 
1037 aa  472  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  36.15 
 
 
719 aa  375  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  38.45 
 
 
798 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  37.03 
 
 
762 aa  360  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  35.27 
 
 
668 aa  357  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 
667 aa  354  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  35.86 
 
 
662 aa  353  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.47 
 
 
806 aa  353  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  33.73 
 
 
857 aa  348  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.52 
 
 
618 aa  347  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.92 
 
 
712 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.28 
 
 
649 aa  341  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  35.79 
 
 
693 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.23 
 
 
643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.23 
 
 
643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.5 
 
 
681 aa  337  9e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  37.69 
 
 
626 aa  336  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 
905 aa  336  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.77 
 
 
661 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.97 
 
 
656 aa  335  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 
704 aa  334  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 
648 aa  328  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.06 
 
 
776 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.5 
 
 
643 aa  327  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  36.12 
 
 
744 aa  326  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 
683 aa  324  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  34.23 
 
 
701 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.44 
 
 
654 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.05 
 
 
765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 
683 aa  322  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.43 
 
 
761 aa  320  7e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 
811 aa  320  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.73 
 
 
640 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.08 
 
 
625 aa  318  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  33.58 
 
 
770 aa  317  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.04 
 
 
708 aa  317  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.72 
 
 
683 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  36.72 
 
 
683 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.25 
 
 
683 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  36.57 
 
 
683 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  36.31 
 
 
683 aa  313  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.57 
 
 
683 aa  313  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  36.31 
 
 
683 aa  313  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.09 
 
 
683 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.99 
 
 
646 aa  312  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 
683 aa  311  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  36.01 
 
 
782 aa  311  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.42 
 
 
824 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  36.41 
 
 
683 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.42 
 
 
824 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.38 
 
 
828 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.52 
 
 
757 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.07 
 
 
714 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.52 
 
 
734 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  37.56 
 
 
714 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.23 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.21 
 
 
755 aa  305  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 
774 aa  304  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.79 
 
 
640 aa  304  7.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.42 
 
 
679 aa  303  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  31.74 
 
 
829 aa  303  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  34.73 
 
 
779 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.5 
 
 
739 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.04 
 
 
727 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  34.01 
 
 
833 aa  300  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.49 
 
 
710 aa  298  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  34.69 
 
 
727 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 
677 aa  296  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.32 
 
 
751 aa  295  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  33.49 
 
 
890 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  31.1 
 
 
814 aa  295  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.14 
 
 
728 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  33.43 
 
 
745 aa  291  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  32.98 
 
 
712 aa  290  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  35.55 
 
 
734 aa  290  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  35.73 
 
 
728 aa  290  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  32.59 
 
 
793 aa  290  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  33.71 
 
 
745 aa  289  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  33.9 
 
 
747 aa  289  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.96 
 
 
741 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  36.42 
 
 
727 aa  288  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  34.94 
 
 
722 aa  288  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.17 
 
 
779 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  36.42 
 
 
727 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  35.94 
 
 
656 aa  287  7e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.91 
 
 
687 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  32.94 
 
 
941 aa  286  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 
723 aa  286  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  33.48 
 
 
745 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.09 
 
 
720 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 
776 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>