More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2000 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  50.66 
 
 		 757 aa  744    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  51.59 
 
 		 756 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 740 aa  1504    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  51.54 
 
 		 751 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  51.83 
 
 		 751 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  50.73 
 
 		 762 aa  734    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  51.54 
 
 		 751 aa  737    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  52.01 
 
 		 750 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1259  peptidoglycan glycosyltransferase  47.86 
 
 		 707 aa  602  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  45.16 
 
 		 712 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  41.58 
 
 		 776 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  38.47 
 
 		 811 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  39.27 
 
 		 824 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  39.6 
 
 		 824 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  41.32 
 
 		 755 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.01 
 
 		 626 aa  363  6e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  40.65 
 
 		 776 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  42.45 
 
 		 714 aa  360  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  40.29 
 
 		 779 aa  357  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  39.57 
 
 		 658 aa  357  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.5 
 
 		 618 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38 
 
 		 643 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 720 aa  352  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38 
 
 		 643 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  41.23 
 
 		 734 aa  350  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 		 728 aa  350  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  38.8 
 
 		 741 aa  349  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  39.11 
 
 		 680 aa  348  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  41.21 
 
 		 714 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  39.08 
 
 		 770 aa  343  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  39.02 
 
 		 602 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  38.07 
 
 		 720 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.08 
 
 		 648 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  39.67 
 
 		 727 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  38.3 
 
 		 732 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  39.67 
 
 		 727 aa  340  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.08 
 
 		 640 aa  340  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  38.09 
 
 		 739 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  37.75 
 
 		 735 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  40.64 
 
 		 712 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.46 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.9 
 
 		 763 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.9 
 
 		 730 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 		 643 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  40.3 
 
 		 723 aa  337  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.29 
 
 		 732 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.41 
 
 		 775 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.93 
 
 		 806 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 661 aa  334  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  39.53 
 
 		 691 aa  333  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  39.13 
 
 		 625 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  40.18 
 
 		 728 aa  331  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.51 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 654 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  38.16 
 
 		 757 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 		 768 aa  324  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  38.26 
 
 		 757 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  37.68 
 
 		 692 aa  323  8e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 		 709 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  37.66 
 
 		 769 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  37.66 
 
 		 750 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  37.02 
 
 		 712 aa  320  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  41.31 
 
 		 796 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  37.63 
 
 		 759 aa  319  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  37.41 
 
 		 759 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  37.43 
 
 		 760 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 833 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 		 750 aa  316  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.95 
 
 		 751 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  40.26 
 
 		 810 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.58 
 
 		 761 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 		 758 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.11 
 
 		 649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 658 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  36.24 
 
 		 714 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 		 744 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  37.86 
 
 		 718 aa  303  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 654 aa  302  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  37.72 
 
 		 626 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  39.19 
 
 		 750 aa  301  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 683 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.86 
 
 		 683 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  35.69 
 
 		 763 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 		 831 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 		 648 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  35.11 
 
 		 760 aa  297  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 724 aa  297  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  38.53 
 
 		 788 aa  297  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  37.57 
 
 		 679 aa  296  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  32.46 
 
 		 589 aa  296  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 729 aa  296  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.27 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  37 
 
 		 718 aa  295  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.25 
 
 		 727 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.09 
 
 		 683 aa  294  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  34.75 
 
 		 784 aa  294  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 		 765 aa  294  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  33.57 
 
 		 683 aa  294  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  33.09 
 
 		 683 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  33.09 
 
 		 683 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>