More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2139 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 774 aa  1561    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  35.1 
 
 		 719 aa  381  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  34.9 
 
 		 762 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  35.45 
 
 		 798 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  36.04 
 
 		 860 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  32.16 
 
 		 857 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  39.43 
 
 		 782 aa  343  9e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  37.9 
 
 		 853 aa  343  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  37.28 
 
 		 801 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  39.34 
 
 		 782 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  38.65 
 
 		 779 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 		 861 aa  333  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 		 855 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.08 
 
 		 793 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 759 aa  311  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  30.28 
 
 		 770 aa  300  7e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  35.76 
 
 		 952 aa  297  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  31.48 
 
 		 980 aa  293  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 908 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 927 aa  287  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  31.09 
 
 		 774 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  32.63 
 
 		 770 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  32.47 
 
 		 770 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  32.47 
 
 		 770 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  32.63 
 
 		 770 aa  262  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  33.06 
 
 		 807 aa  262  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.97 
 
 		 661 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  32.31 
 
 		 770 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33.5 
 
 		 668 aa  261  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  32.73 
 
 		 770 aa  260  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  32.31 
 
 		 770 aa  260  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  32.31 
 
 		 770 aa  260  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  32.31 
 
 		 770 aa  258  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  32.21 
 
 		 681 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  33.8 
 
 		 774 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  29.9 
 
 		 766 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  33.74 
 
 		 771 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 		 691 aa  252  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  33.74 
 
 		 771 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  33.74 
 
 		 771 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 1037 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  32.79 
 
 		 793 aa  250  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  33.57 
 
 		 771 aa  250  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 		 656 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  33.22 
 
 		 771 aa  246  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 		 648 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.88 
 
 		 811 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  33.22 
 
 		 780 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31 
 
 		 683 aa  245  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  31.62 
 
 		 626 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 648 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  30.87 
 
 		 782 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  29.56 
 
 		 705 aa  242  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 704 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  38 
 
 		 747 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  31.91 
 
 		 693 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  37.45 
 
 		 745 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  31.33 
 
 		 713 aa  241  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 		 824 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  30.67 
 
 		 784 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  34.78 
 
 		 774 aa  240  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33.76 
 
 		 712 aa  240  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  33.62 
 
 		 784 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.33 
 
 		 728 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.44 
 
 		 727 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.68 
 
 		 833 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  31.12 
 
 		 780 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.5 
 
 		 727 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.67 
 
 		 824 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  28.35 
 
 		 762 aa  239  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 683 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  33.85 
 
 		 782 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.47 
 
 		 806 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  36.91 
 
 		 745 aa  238  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  33.45 
 
 		 784 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  33.33 
 
 		 784 aa  237  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  31.22 
 
 		 683 aa  237  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.49 
 
 		 734 aa  237  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  31.58 
 
 		 784 aa  237  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.68 
 
 		 776 aa  236  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  34.15 
 
 		 746 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.22 
 
 		 683 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.22 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  34.09 
 
 		 677 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 		 747 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 		 747 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 		 747 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 683 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  27.43 
 
 		 774 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 649 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  32.22 
 
 		 844 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.03 
 
 		 646 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  30.19 
 
 		 787 aa  233  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  30.19 
 
 		 787 aa  233  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  30.19 
 
 		 787 aa  233  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 683 aa  233  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  33.33 
 
 		 774 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  36.33 
 
 		 745 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>