More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4091 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  71.43 
 
 
942 aa  1008    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  70.8 
 
 
785 aa  978    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  57.35 
 
 
746 aa  794    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  56.17 
 
 
774 aa  731    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  70.49 
 
 
951 aa  1007    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  56.25 
 
 
784 aa  724    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  57.45 
 
 
758 aa  733    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  90.85 
 
 
747 aa  1323    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  56.32 
 
 
768 aa  727    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  55.27 
 
 
742 aa  729    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  89.76 
 
 
747 aa  1295    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  55.6 
 
 
747 aa  732    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  71.57 
 
 
1060 aa  826    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 
745 aa  1471    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  76.04 
 
 
913 aa  1126    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  81.32 
 
 
844 aa  1187    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  57.96 
 
 
726 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  89.76 
 
 
747 aa  1295    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  91.77 
 
 
745 aa  1314    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  69.69 
 
 
923 aa  998    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  91.09 
 
 
745 aa  1324    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  89.76 
 
 
747 aa  1295    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  46.76 
 
 
713 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  48.25 
 
 
705 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  44.99 
 
 
729 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  34.23 
 
 
719 aa  364  3e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  35.7 
 
 
759 aa  321  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  31.81 
 
 
762 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  33.38 
 
 
798 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  32.8 
 
 
857 aa  292  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 
952 aa  290  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  29.49 
 
 
770 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  38.29 
 
 
860 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  38.08 
 
 
853 aa  280  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  35.69 
 
 
801 aa  273  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  40.45 
 
 
779 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  40.64 
 
 
782 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  39.66 
 
 
782 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  32.82 
 
 
861 aa  250  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 
855 aa  247  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.89 
 
 
793 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.14 
 
 
774 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  31.95 
 
 
766 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  30.28 
 
 
816 aa  240  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  30.65 
 
 
774 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  35.22 
 
 
780 aa  237  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  32.77 
 
 
980 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  34.69 
 
 
807 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  32.25 
 
 
780 aa  234  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  35.23 
 
 
679 aa  232  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  35.14 
 
 
782 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  36 
 
 
774 aa  227  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.6 
 
 
727 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  35 
 
 
770 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.6 
 
 
727 aa  225  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  35.14 
 
 
782 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  35 
 
 
770 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.122147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  34.82 
 
 
770 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  34.82 
 
 
770 aa  223  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  34.82 
 
 
770 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  34.82 
 
 
770 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  35 
 
 
770 aa  223  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  34.82 
 
 
770 aa  223  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  36.07 
 
 
771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  36.07 
 
 
771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  34.12 
 
 
712 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  36.25 
 
 
771 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  35.82 
 
 
706 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  35.91 
 
 
680 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  33.94 
 
 
696 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  35.52 
 
 
771 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  35.34 
 
 
745 aa  221  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  34.82 
 
 
770 aa  221  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  35.52 
 
 
771 aa  220  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  34.83 
 
 
731 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.16 
 
 
734 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  33.51 
 
 
774 aa  219  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
927 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 
728 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  34.13 
 
 
706 aa  218  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  30.69 
 
 
701 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  29.46 
 
 
648 aa  217  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  35.35 
 
 
784 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  32.84 
 
 
662 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  35.26 
 
 
750 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
1037 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  35.32 
 
 
784 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  36.21 
 
 
799 aa  214  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
908 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  29.95 
 
 
797 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  35.43 
 
 
784 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 
728 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  35.1 
 
 
784 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34 
 
 
732 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  36.02 
 
 
696 aa  213  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  28.94 
 
 
734 aa  212  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  33.7 
 
 
695 aa  212  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.73 
 
 
770 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  35.45 
 
 
794 aa  211  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  30.76 
 
 
762 aa  210  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>