More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1168 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  62.28 
 
 
762 aa  961    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 
798 aa  1626    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  36.35 
 
 
719 aa  444  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  40.36 
 
 
782 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  38.71 
 
 
779 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  40.36 
 
 
782 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.86 
 
 
860 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  39.63 
 
 
853 aa  376  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  32.56 
 
 
857 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 
801 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  38.45 
 
 
952 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  37.54 
 
 
855 aa  346  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  38.55 
 
 
861 aa  346  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  37.87 
 
 
927 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
774 aa  344  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  38.47 
 
 
908 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
759 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  35.28 
 
 
980 aa  333  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  40.52 
 
 
705 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  33.11 
 
 
766 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  40.55 
 
 
713 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  34.71 
 
 
793 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  33.7 
 
 
745 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  32.53 
 
 
770 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  35.17 
 
 
758 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  30.35 
 
 
816 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  33.29 
 
 
747 aa  301  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  32.98 
 
 
844 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  32.98 
 
 
747 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  32.98 
 
 
747 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  32.98 
 
 
747 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  33.33 
 
 
745 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  36.9 
 
 
742 aa  296  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0242  glycosyl transferase family 51  33.47 
 
 
810 aa  295  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.378731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  34.87 
 
 
794 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  34.07 
 
 
768 aa  293  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 
1037 aa  292  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  38.16 
 
 
746 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  34.95 
 
 
747 aa  288  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  37.91 
 
 
784 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  36.92 
 
 
774 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  32.24 
 
 
745 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  34.55 
 
 
729 aa  281  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  34.54 
 
 
797 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  34.17 
 
 
785 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  33.5 
 
 
780 aa  279  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  35.26 
 
 
787 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  35.26 
 
 
787 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  35.26 
 
 
787 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  30.32 
 
 
774 aa  275  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.12 
 
 
618 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  35.15 
 
 
794 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  36.48 
 
 
807 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1530  penicillin-binding protein 1C  33.51 
 
 
764 aa  269  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  35.74 
 
 
784 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  36.33 
 
 
726 aa  269  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  30.71 
 
 
762 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  34.55 
 
 
770 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  34.55 
 
 
770 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  34.49 
 
 
770 aa  267  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  34.25 
 
 
770 aa  267  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  34.25 
 
 
770 aa  267  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  35.15 
 
 
794 aa  267  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  36.42 
 
 
784 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  34.93 
 
 
782 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  36.32 
 
 
784 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  36.58 
 
 
784 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  34.25 
 
 
770 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  33.82 
 
 
770 aa  266  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0309  penicillin-binding protein 1C  29.92 
 
 
792 aa  265  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  34.25 
 
 
770 aa  265  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  34.25 
 
 
770 aa  264  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  34.73 
 
 
793 aa  264  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  33.5 
 
 
712 aa  264  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  34.41 
 
 
760 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  34.41 
 
 
762 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  32.35 
 
 
744 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  35.61 
 
 
782 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  34.24 
 
 
760 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  32.83 
 
 
774 aa  262  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  35.59 
 
 
771 aa  260  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  35.59 
 
 
771 aa  260  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  34.07 
 
 
760 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  33.27 
 
 
706 aa  259  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  32.8 
 
 
706 aa  259  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  36.35 
 
 
696 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  34.68 
 
 
774 aa  258  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  35.4 
 
 
771 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  35.4 
 
 
771 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  34.43 
 
 
680 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  35.4 
 
 
771 aa  257  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 
775 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.57 
 
 
654 aa  254  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  31 
 
 
701 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  27.15 
 
 
734 aa  254  5.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  33.66 
 
 
750 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  30.12 
 
 
772 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  30.12 
 
 
775 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  35.53 
 
 
774 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.2 
 
 
648 aa  250  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>