More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0426 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  100 
 
 		 589 aa  1157    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  94.57 
 
 		 589 aa  1104    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  72.46 
 
 		 589 aa  787    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  93.89 
 
 		 589 aa  1087    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  42.64 
 
 		 602 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  39.74 
 
 		 658 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  39.19 
 
 		 680 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.19 
 
 		 692 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.4 
 
 		 712 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 		 776 aa  355  8.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.74 
 
 		 626 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.82 
 
 		 755 aa  343  4e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.88 
 
 		 824 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.09 
 
 		 811 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.88 
 
 		 824 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.36 
 
 		 761 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.44 
 
 		 727 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  32.39 
 
 		 712 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.59 
 
 		 739 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 775 aa  292  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  32.47 
 
 		 768 aa  292  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  31.24 
 
 		 732 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.73 
 
 		 734 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 720 aa  289  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  30.8 
 
 		 720 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  30.23 
 
 		 709 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  30.64 
 
 		 735 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  32.24 
 
 		 626 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.21 
 
 		 648 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 727 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 		 763 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  31.33 
 
 		 727 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.37 
 
 		 770 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  30.99 
 
 		 728 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.22 
 
 		 806 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  31.05 
 
 		 796 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.31 
 
 		 643 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.7 
 
 		 646 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  29.31 
 
 		 759 aa  281  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  31.71 
 
 		 740 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.64 
 
 		 779 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 741 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 		 730 aa  277  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.66 
 
 		 776 aa  277  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  28.7 
 
 		 760 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 		 763 aa  276  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  28.41 
 
 		 765 aa  276  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.67 
 
 		 712 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  29.2 
 
 		 734 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.12 
 
 		 757 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  30.4 
 
 		 728 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 718 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  30.36 
 
 		 765 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  29.74 
 
 		 732 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  30.36 
 
 		 784 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  30 
 
 		 760 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  29.43 
 
 		 714 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 833 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  32.28 
 
 		 750 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  28.6 
 
 		 759 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 		 727 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  29.72 
 
 		 714 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  31.43 
 
 		 658 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  29.33 
 
 		 769 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  30.83 
 
 		 640 aa  270  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  28.95 
 
 		 750 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  29.34 
 
 		 656 aa  270  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.29 
 
 		 742 aa  270  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  29.21 
 
 		 757 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 661 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  31.66 
 
 		 756 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.06 
 
 		 640 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  31.19 
 
 		 669 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 810 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  30.23 
 
 		 712 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 		 706 aa  266  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  32.82 
 
 		 676 aa  266  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  31.1 
 
 		 744 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  33.95 
 
 		 705 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  33.95 
 
 		 705 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.79 
 
 		 757 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  33.58 
 
 		 705 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  33.58 
 
 		 705 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  33.58 
 
 		 705 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  29.82 
 
 		 651 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 		 643 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 		 643 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.31 
 
 		 751 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  33.76 
 
 		 746 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  28.22 
 
 		 758 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  28.5 
 
 		 691 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  33.52 
 
 		 705 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  33.21 
 
 		 746 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  30.13 
 
 		 709 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.31 
 
 		 751 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  29.81 
 
 		 830 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 830 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 718 aa  259  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  33.03 
 
 		 705 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  32.49 
 
 		 699 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>