More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_04511 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  100 
 
 
589 aa  1168    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  94.57 
 
 
589 aa  1104    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  71.9 
 
 
589 aa  787    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  94.06 
 
 
589 aa  1097    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  42.78 
 
 
602 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  39.89 
 
 
658 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  39.56 
 
 
680 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.38 
 
 
692 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.21 
 
 
712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.92 
 
 
776 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.17 
 
 
755 aa  343  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.83 
 
 
626 aa  342  9e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.64 
 
 
811 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  36.25 
 
 
824 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.25 
 
 
824 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.89 
 
 
727 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.36 
 
 
761 aa  302  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  31.06 
 
 
712 aa  296  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  32.47 
 
 
768 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.16 
 
 
720 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  28.6 
 
 
739 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  30.93 
 
 
796 aa  286  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.42 
 
 
734 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 
763 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  28.12 
 
 
775 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  33.2 
 
 
626 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  30.54 
 
 
735 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 
720 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  29.6 
 
 
727 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  30.29 
 
 
732 aa  281  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  29.6 
 
 
727 aa  281  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.02 
 
 
806 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.38 
 
 
648 aa  280  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  29.87 
 
 
709 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.46 
 
 
770 aa  280  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  29.11 
 
 
759 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.64 
 
 
643 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  26.39 
 
 
741 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  27.76 
 
 
765 aa  276  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  30.63 
 
 
728 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  28.57 
 
 
760 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  28.64 
 
 
714 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 
779 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.67 
 
 
712 aa  273  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.31 
 
 
757 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.21 
 
 
646 aa  273  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  31.63 
 
 
730 aa  273  8.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.63 
 
 
763 aa  272  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  29.85 
 
 
656 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 
776 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  29.6 
 
 
728 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  28.84 
 
 
718 aa  270  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  31.41 
 
 
756 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
833 aa  270  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  30.6 
 
 
740 aa  270  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  27.23 
 
 
734 aa  269  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  28.6 
 
 
714 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  29.98 
 
 
640 aa  269  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  30.04 
 
 
760 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  30.22 
 
 
765 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  29.56 
 
 
757 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  30.22 
 
 
784 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  30.99 
 
 
658 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  31.25 
 
 
727 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  28.36 
 
 
759 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  28.96 
 
 
732 aa  267  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 
706 aa  266  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.53 
 
 
750 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  28.68 
 
 
769 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  30.27 
 
 
810 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  28.29 
 
 
750 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  29.91 
 
 
742 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  28.92 
 
 
691 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.68 
 
 
640 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  30.13 
 
 
709 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  30.2 
 
 
830 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  29.81 
 
 
830 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.96 
 
 
661 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  33.15 
 
 
705 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  33.15 
 
 
705 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  29.88 
 
 
643 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  29.88 
 
 
643 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  29.65 
 
 
712 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  31.33 
 
 
669 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  32.77 
 
 
705 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  32.77 
 
 
705 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  32.77 
 
 
705 aa  260  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.37 
 
 
757 aa  260  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  29.63 
 
 
651 aa  259  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  30.48 
 
 
744 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  32.4 
 
 
746 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  27.73 
 
 
729 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  32.22 
 
 
705 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 
676 aa  258  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 
746 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  27.76 
 
 
758 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  30.64 
 
 
751 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  31.96 
 
 
705 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  28.24 
 
 
714 aa  256  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  30.76 
 
 
679 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>