More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04821 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  94.06 
 
 		 589 aa  1097    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  93.89 
 
 		 589 aa  1087    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  72.27 
 
 		 589 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  100 
 
 		 589 aa  1158    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  42.99 
 
 		 602 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  39.33 
 
 		 658 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  39.14 
 
 		 680 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.58 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  37.34 
 
 		 712 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.68 
 
 		 776 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 		 755 aa  343  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.61 
 
 		 626 aa  336  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.92 
 
 		 824 aa  326  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.92 
 
 		 824 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.47 
 
 		 811 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.65 
 
 		 761 aa  296  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.67 
 
 		 727 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  31.06 
 
 		 712 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  29.33 
 
 		 739 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  31.43 
 
 		 768 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 727 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 		 727 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.88 
 
 		 720 aa  282  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  33.08 
 
 		 626 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  29.04 
 
 		 734 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  30.2 
 
 		 728 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 		 763 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  29.49 
 
 		 646 aa  280  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.94 
 
 		 648 aa  280  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.84 
 
 		 806 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  29.03 
 
 		 735 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  28.74 
 
 		 720 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.77 
 
 		 643 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.82 
 
 		 833 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  30.1 
 
 		 732 aa  276  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  30.48 
 
 		 796 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  30.63 
 
 		 759 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 709 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  29.28 
 
 		 718 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 728 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.76 
 
 		 640 aa  274  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  26.83 
 
 		 741 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 		 770 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.8 
 
 		 712 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  28.52 
 
 		 775 aa  273  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  27.82 
 
 		 734 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.57 
 
 		 640 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  28.68 
 
 		 760 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  28.96 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.83 
 
 		 776 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  28.05 
 
 		 765 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.64 
 
 		 779 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  30.22 
 
 		 656 aa  269  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  30.67 
 
 		 740 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  28.69 
 
 		 714 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  28.5 
 
 		 732 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 714 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 784 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  29.76 
 
 		 760 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  29.85 
 
 		 651 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  29.95 
 
 		 765 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  31.23 
 
 		 669 aa  267  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 		 730 aa  267  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.87 
 
 		 742 aa  267  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 		 763 aa  266  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  32.33 
 
 		 750 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  28.17 
 
 		 759 aa  266  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  31.02 
 
 		 727 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.02 
 
 		 661 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  28.54 
 
 		 769 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  28.65 
 
 		 757 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  32.38 
 
 		 658 aa  265  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  27.98 
 
 		 750 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  30.31 
 
 		 706 aa  263  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  29.44 
 
 		 691 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  29.64 
 
 		 643 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  29.64 
 
 		 643 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  29.86 
 
 		 709 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 810 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  31.11 
 
 		 756 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  30.87 
 
 		 744 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 714 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.52 
 
 		 751 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  29.82 
 
 		 761 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  27.98 
 
 		 724 aa  257  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 723 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.8 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  27.76 
 
 		 718 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 831 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  29.11 
 
 		 751 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.65 
 
 		 751 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  28.23 
 
 		 758 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 712 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  33.77 
 
 		 705 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 649 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  29.69 
 
 		 830 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  33.77 
 
 		 705 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  26.46 
 
 		 788 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  29.3 
 
 		 830 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  33.4 
 
 		 705 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>