57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0670 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 1024 aa  2016    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  45.58 
 
 		 1314 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  46.9 
 
 		 646 aa  227  9e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  35.28 
 
 		 1189 aa  225  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  39.07 
 
 		 1814 aa  205  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  50.91 
 
 		 1482 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  28.57 
 
 		 744 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  29.96 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  53.7 
 
 		 873 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  33.73 
 
 		 376 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  29.88 
 
 		 2004 aa  124  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  34.47 
 
 		 1017 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  36.94 
 
 		 425 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  47.97 
 
 		 489 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1321 aa  94.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 2082 aa  93.2  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  35.67 
 
 		 1236 aa  93.6  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  59.46 
 
 		 679 aa  89  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  57.14 
 
 		 717 aa  84.7  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  60.61 
 
 		 518 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  33.92 
 
 		 1601 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  27.36 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  55.32 
 
 		 524 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.41 
 
 		 607 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.81 
 
 		 616 aa  67.4  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  43.66 
 
 		 724 aa  63.9  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  24.77 
 
 		 897 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  28.76 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  28.16 
 
 		 931 aa  58.9  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2598  hypothetical protein  27.95 
 
 		 369 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  26.06 
 
 		 857 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1030 aa  57.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 1184 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2337  hypothetical protein  27.22 
 
 		 298 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00785704  normal  0.0148689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  28.14 
 
 		 323 aa  53.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  25.62 
 
 		 4881 aa  53.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  39.73 
 
 		 885 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  28.21 
 
 		 722 aa  50.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4030  hypothetical protein  27.19 
 
 		 298 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  25.64 
 
 		 597 aa  49.7  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  26.39 
 
 		 409 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  27.47 
 
 		 378 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  27.78 
 
 		 1106 aa  48.9  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  30.3 
 
 		 335 aa  48.9  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1406 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4694  hypothetical protein  22.89 
 
 		 351 aa  48.9  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1067  hypothetical protein  31.15 
 
 		 334 aa  48.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  22.17 
 
 		 695 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  36.7 
 
 		 3320 aa  47.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  24.04 
 
 		 626 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1110 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2878  histidine kinase  34.33 
 
 		 968 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.799361  normal  0.0181006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  28.28 
 
 		 350 aa  45.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  31.15 
 
 		 614 aa  44.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  26.29 
 
 		 692 aa  44.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  22.82 
 
 		 376 aa  44.3  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>