16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2024 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  50.68 
 
 		 1236 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  45.45 
 
 		 489 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  41.79 
 
 		 873 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1024 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  36.46 
 
 		 717 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  42.19 
 
 		 518 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  42.19 
 
 		 1482 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.71 
 
 		 1189 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  40.98 
 
 		 1814 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 2082 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  40.62 
 
 		 679 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  45.1 
 
 		 646 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1321 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.82 
 
 		 607 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1314 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>