27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1944 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1399    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  42.58 
 
 		 717 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  59.46 
 
 		 1024 aa  89  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1314 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.33 
 
 		 1482 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  59.72 
 
 		 2082 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  54.29 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  57.14 
 
 		 873 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  50 
 
 		 646 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  53.52 
 
 		 1189 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2462  hypothetical protein  22.82 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  48.48 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  37.93 
 
 		 724 aa  60.8  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  44.59 
 
 		 1814 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  39.02 
 
 		 1236 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.79 
 
 		 607 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1321 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  48.48 
 
 		 524 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1406 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  41.94 
 
 		 885 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1017 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  34.69 
 
 		 2004 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 1184 aa  47.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  40.62 
 
 		 101 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  38.24 
 
 		 722 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  31.25 
 
 		 538 aa  45.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2421  hypothetical protein  20.94 
 
 		 415 aa  43.9  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>