148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1444 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 1184 aa  2416    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2878  histidine kinase  67 
 
 		 968 aa  1242    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.799361  normal  0.0181006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  46.07 
 
 		 1028 aa  231  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40.37 
 
 		 722 aa  150  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.02 
 
 		 1564 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.88 
 
 		 915 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  36.74 
 
 		 850 aa  128  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.57 
 
 		 674 aa  128  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.38 
 
 		 962 aa  123  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.73 
 
 		 581 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.09 
 
 		 1158 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  31.5 
 
 		 4013 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  32.62 
 
 		 752 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.46 
 
 		 578 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  31.02 
 
 		 1441 aa  108  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  47.86 
 
 		 879 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  29.55 
 
 		 1581 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  30.26 
 
 		 588 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  31.68 
 
 		 987 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.09 
 
 		 815 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.4 
 
 		 1139 aa  88.2  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.2 
 
 		 1362 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 		 641 aa  77  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.62 
 
 		 637 aa  77.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 		 642 aa  77  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  27.06 
 
 		 1471 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  38.98 
 
 		 433 aa  73.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.8 
 
 		 929 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.43 
 
 		 722 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  34.62 
 
 		 571 aa  72  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  33.12 
 
 		 289 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.05 
 
 		 282 aa  71.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.9 
 
 		 288 aa  71.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  38.94 
 
 		 801 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.76 
 
 		 953 aa  70.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 1332 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.65 
 
 		 1321 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  32.48 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.09 
 
 		 478 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.85 
 
 		 252 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.79 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  35.4 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.85 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  29.84 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.72 
 
 		 819 aa  68.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  30.74 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.79 
 
 		 1007 aa  68.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  30.88 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 556 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  32.43 
 
 		 291 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  27.37 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.37 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  34.17 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.17 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.7 
 
 		 639 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.06 
 
 		 423 aa  64.3  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 480 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  27.04 
 
 		 274 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  28.8 
 
 		 283 aa  64.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  37.82 
 
 		 475 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  29.19 
 
 		 389 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  27.84 
 
 		 558 aa  63.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.49 
 
 		 1290 aa  63.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.59 
 
 		 1117 aa  63.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  37.14 
 
 		 999 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  36.04 
 
 		 1070 aa  62.4  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.07 
 
 		 261 aa  62  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  25.9 
 
 		 238 aa  62  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  34.48 
 
 		 383 aa  62  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.91 
 
 		 986 aa  61.6  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  29.22 
 
 		 883 aa  61.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.04 
 
 		 472 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.98 
 
 		 627 aa  61.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  29.38 
 
 		 1028 aa  61.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.04 
 
 		 472 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.7 
 
 		 695 aa  60.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.81 
 
 		 1448 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  33.65 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.66 
 
 		 971 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.83 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  30.72 
 
 		 286 aa  60.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.62 
 
 		 1338 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.54 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.45 
 
 		 940 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  26.39 
 
 		 1103 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  31.9 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.17 
 
 		 1694 aa  58.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.95 
 
 		 984 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  44.44 
 
 		 646 aa  57.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 1321 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1819  hypothetical protein  53.06 
 
 		 181 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.47 
 
 		 1482 aa  56.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 427 aa  56.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.41 
 
 		 1255 aa  55.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.22 
 
 		 1060 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  29.22 
 
 		 271 aa  55.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  34.94 
 
 		 489 aa  55.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.11 
 
 		 426 aa  55.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>