163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0478 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 1028 aa  2128    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  53.98 
 
 		 879 aa  872    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.09 
 
 		 1707 aa  333  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  35.43 
 
 		 970 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  42.82 
 
 		 475 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  42.05 
 
 		 475 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  42.05 
 
 		 475 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  42.05 
 
 		 475 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  44.47 
 
 		 475 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  43.96 
 
 		 475 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  40 
 
 		 471 aa  279  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  41.6 
 
 		 461 aa  275  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  41.82 
 
 		 473 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  41.82 
 
 		 473 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  40.57 
 
 		 460 aa  272  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  41.69 
 
 		 510 aa  271  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  40.62 
 
 		 443 aa  270  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  39.41 
 
 		 502 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  41.07 
 
 		 462 aa  263  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  38.32 
 
 		 502 aa  263  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  39.23 
 
 		 450 aa  262  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  40.1 
 
 		 501 aa  261  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  37.64 
 
 		 502 aa  260  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  40.77 
 
 		 452 aa  260  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  41.03 
 
 		 475 aa  259  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  41.4 
 
 		 480 aa  259  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  36.76 
 
 		 512 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  42.6 
 
 		 470 aa  255  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  39.66 
 
 		 503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  37.09 
 
 		 469 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  37.47 
 
 		 456 aa  254  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  39.16 
 
 		 475 aa  251  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  39.5 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  38.78 
 
 		 512 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  35.32 
 
 		 517 aa  248  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  41.22 
 
 		 418 aa  247  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  36.46 
 
 		 459 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  38.97 
 
 		 517 aa  245  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  37.06 
 
 		 492 aa  243  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  41.86 
 
 		 471 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  37.47 
 
 		 562 aa  241  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  37.84 
 
 		 541 aa  240  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  37.66 
 
 		 479 aa  239  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  35.23 
 
 		 528 aa  237  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  36.97 
 
 		 560 aa  236  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  46.27 
 
 		 1184 aa  226  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  35.05 
 
 		 491 aa  223  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  33.13 
 
 		 543 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  40.32 
 
 		 427 aa  219  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  33.96 
 
 		 541 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  33.96 
 
 		 541 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  33.05 
 
 		 549 aa  209  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  32.99 
 
 		 542 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  36.86 
 
 		 538 aa  205  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  34.22 
 
 		 548 aa  204  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  36.42 
 
 		 551 aa  198  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  30.46 
 
 		 539 aa  190  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.77 
 
 		 1564 aa  189  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  34.64 
 
 		 737 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  32.59 
 
 		 472 aa  171  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.45 
 
 		 962 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 674 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.91 
 
 		 1158 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  39.94 
 
 		 987 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 421 aa  160  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.3 
 
 		 815 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  38.21 
 
 		 850 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.03 
 
 		 915 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  39.38 
 
 		 794 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  38.65 
 
 		 4013 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  37.24 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.15 
 
 		 581 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.41 
 
 		 578 aa  138  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  37.92 
 
 		 1441 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  33.55 
 
 		 1581 aa  135  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  50 
 
 		 722 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  36.1 
 
 		 752 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  28.85 
 
 		 511 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  30.37 
 
 		 1471 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.4 
 
 		 1139 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  40.72 
 
 		 433 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  46.34 
 
 		 449 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.91 
 
 		 1362 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.71 
 
 		 755 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.65 
 
 		 637 aa  95.5  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.09 
 
 		 929 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.31 
 
 		 953 aa  89.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  38.78 
 
 		 801 aa  88.6  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  32.25 
 
 		 578 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.93 
 
 		 722 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.79 
 
 		 756 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  37.34 
 
 		 571 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  40.77 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.57 
 
 		 940 aa  85.5  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.41 
 
 		 1007 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  43.86 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.86 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.86 
 
 		 480 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  40.3 
 
 		 1059 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  38.73 
 
 		 732 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>