76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2722 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  100 
 
 		 427 aa  868    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  51.82 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  45.71 
 
 		 473 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  45.71 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  44.39 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  44.39 
 
 		 475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  47.33 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  43.91 
 
 		 475 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  44.19 
 
 		 502 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  43.19 
 
 		 503 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  45.85 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  44.14 
 
 		 475 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  45.33 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  43.78 
 
 		 512 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  43.22 
 
 		 475 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  44.73 
 
 		 502 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  43.45 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  43.95 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  44.6 
 
 		 501 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  43.5 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  44.03 
 
 		 502 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  41.61 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  41.61 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  44.93 
 
 		 512 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  45.01 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  44.02 
 
 		 503 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  45.94 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  42.47 
 
 		 510 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  41.76 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  41.65 
 
 		 462 aa  299  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  43.65 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  43.94 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  41.65 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  40.74 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  39.34 
 
 		 551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  41.71 
 
 		 479 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  39 
 
 		 541 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  39.71 
 
 		 542 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  41.76 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  39.96 
 
 		 548 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  42.51 
 
 		 970 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  38.38 
 
 		 541 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  40.14 
 
 		 528 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  39.09 
 
 		 543 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  40.27 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  37.79 
 
 		 538 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  37.89 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  38.1 
 
 		 539 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  40.72 
 
 		 1707 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  34.34 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  35.9 
 
 		 541 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  41.16 
 
 		 879 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  38.15 
 
 		 562 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  37.1 
 
 		 560 aa  243  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  34.84 
 
 		 491 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  40.59 
 
 		 1028 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  32.74 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  37.8 
 
 		 737 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  35.8 
 
 		 421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  33.17 
 
 		 794 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  28.38 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  26.59 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  25.94 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  27 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  32.95 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  39.08 
 
 		 106 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.77 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.47 
 
 		 652 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  30.56 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  53.66 
 
 		 41 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.08 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  26.89 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  27.93 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  28.81 
 
 		 331 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>