67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0564 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  100 
 
 		 510 aa  1041    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  64.64 
 
 		 502 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  65.03 
 
 		 502 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  67.29 
 
 		 501 aa  661    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  72.33 
 
 		 517 aa  734    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  65.03 
 
 		 502 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  58.99 
 
 		 512 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  57.26 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  58.14 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  54.39 
 
 		 475 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  55.26 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  55.16 
 
 		 475 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  54.17 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  53.95 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  53.85 
 
 		 475 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  54.64 
 
 		 517 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  54.39 
 
 		 475 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  51.4 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  55.46 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  56.8 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  52.43 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  52.35 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  54.57 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  51 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  51.81 
 
 		 528 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  54.7 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  51.68 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  48.23 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  45.75 
 
 		 475 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  48.27 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  47.25 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  46.18 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  43.92 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  45.25 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  45.25 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  47.69 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  41.03 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  44.44 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  41.59 
 
 		 450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  41.28 
 
 		 459 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  41.07 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  40.8 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  42.47 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  39.08 
 
 		 541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  40.08 
 
 		 542 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  39.12 
 
 		 548 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  38.08 
 
 		 541 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  38.11 
 
 		 538 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  37.9 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  37.83 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  38.98 
 
 		 549 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  37.47 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  39.03 
 
 		 879 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  41.69 
 
 		 1028 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  37.41 
 
 		 970 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  40 
 
 		 421 aa  246  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.29 
 
 		 1707 aa  240  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  35.32 
 
 		 737 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  30.88 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  33.33 
 
 		 794 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  27.47 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  26.83 
 
 		 519 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  28.25 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  30.61 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.17 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  55.26 
 
 		 41 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  29.2 
 
 		 322 aa  44.3  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>