299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3699 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
328 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  98.97 
 
 
297 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  57 
 
 
308 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  58.36 
 
 
333 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  36.75 
 
 
383 aa  235  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  38.99 
 
 
369 aa  232  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  37.22 
 
 
401 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  37.8 
 
 
427 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  35.28 
 
 
395 aa  212  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  41.03 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  40.62 
 
 
357 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  37.8 
 
 
398 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  34.41 
 
 
398 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.58 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  33.83 
 
 
365 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  37.17 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  35.44 
 
 
390 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  38.11 
 
 
377 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.05 
 
 
311 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 
360 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  37.18 
 
 
334 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 
365 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  32.79 
 
 
343 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  35.36 
 
 
431 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.51 
 
 
398 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  37.21 
 
 
521 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  37.87 
 
 
352 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  39.2 
 
 
352 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  39.53 
 
 
352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  41.27 
 
 
353 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  33.45 
 
 
359 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.91 
 
 
335 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 
352 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  35.59 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  35.14 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
379 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  33.01 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 
368 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  32.51 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  39.04 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  35.4 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.93 
 
 
626 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
346 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 
417 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 
377 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  33.79 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.96 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.94 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  30.09 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  28.93 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  33.92 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  31.62 
 
 
459 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  30.75 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  34.04 
 
 
459 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  34.04 
 
 
459 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  34.04 
 
 
459 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  31.01 
 
 
384 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.98 
 
 
437 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.78 
 
 
345 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  30.33 
 
 
347 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  33.86 
 
 
328 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.46 
 
 
369 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  31.73 
 
 
324 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
473 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 
463 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.05 
 
 
768 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  31.33 
 
 
345 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  35.94 
 
 
365 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  31.58 
 
 
333 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  30.45 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  30.63 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  34.22 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  34.75 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  28.43 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  30.66 
 
 
333 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  30.1 
 
 
304 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  32.95 
 
 
464 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  32.2 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  35.6 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  32.11 
 
 
465 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  32.11 
 
 
465 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  32.11 
 
 
465 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  32.11 
 
 
465 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  31.48 
 
 
330 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.11 
 
 
465 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  30.42 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.11 
 
 
465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.11 
 
 
465 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  31.64 
 
 
328 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  31.49 
 
 
317 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  35.6 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  32.18 
 
 
466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  32.18 
 
 
466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  32.19 
 
 
466 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  32.18 
 
 
466 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  32.18 
 
 
466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>