More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4658 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
768 aa  1560    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  43.86 
 
 
417 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  38.11 
 
 
384 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  42.54 
 
 
357 aa  222  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  41.3 
 
 
358 aa  222  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  41.18 
 
 
343 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 
346 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  35.28 
 
 
346 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  39.29 
 
 
336 aa  216  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  38.91 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  39.94 
 
 
328 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  38.15 
 
 
626 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  41.5 
 
 
343 aa  206  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  42.11 
 
 
379 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  38.22 
 
 
353 aa  205  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 
369 aa  204  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  34.08 
 
 
346 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  37.85 
 
 
346 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  39.62 
 
 
334 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  40.89 
 
 
431 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  38.64 
 
 
346 aa  200  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  36.95 
 
 
333 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 
346 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  35.91 
 
 
358 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  39.02 
 
 
333 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  35.47 
 
 
345 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  35.47 
 
 
342 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.2 
 
 
345 aa  194  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  35.1 
 
 
340 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  36.53 
 
 
345 aa  193  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 
352 aa  192  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  38.41 
 
 
592 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  34.53 
 
 
339 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  35.26 
 
 
330 aa  191  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  37.39 
 
 
352 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  40 
 
 
411 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  35.91 
 
 
331 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  36.49 
 
 
626 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  38.32 
 
 
371 aa  189  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  37.62 
 
 
598 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  36.66 
 
 
351 aa  188  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.35 
 
 
330 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  37.54 
 
 
352 aa  188  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  36.77 
 
 
594 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 
431 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  37.38 
 
 
348 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  36.16 
 
 
521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  37.22 
 
 
352 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  37.42 
 
 
377 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.92 
 
 
353 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  35.49 
 
 
352 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  33.69 
 
 
359 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  38.76 
 
 
616 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  40.07 
 
 
437 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.23 
 
 
358 aa  185  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 
384 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  34.37 
 
 
330 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  34.14 
 
 
397 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  35.08 
 
 
349 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  37.97 
 
 
613 aa  182  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  33.91 
 
 
337 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.74 
 
 
333 aa  181  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 
333 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.37 
 
 
333 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 
333 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  32.83 
 
 
333 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  34.73 
 
 
377 aa  179  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  35.95 
 
 
607 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  39.22 
 
 
311 aa  178  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  34.59 
 
 
352 aa  177  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  35.62 
 
 
571 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  34.39 
 
 
365 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  34.42 
 
 
333 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  34.3 
 
 
346 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
344 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  37.87 
 
 
398 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
344 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 
344 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  34.58 
 
 
331 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
344 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  34.25 
 
 
350 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  34.69 
 
 
346 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  34.48 
 
 
333 aa  174  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  33.86 
 
 
355 aa  174  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  37.46 
 
 
365 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  36.28 
 
 
335 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  35.29 
 
 
347 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  35.51 
 
 
427 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  35.62 
 
 
347 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  35.29 
 
 
373 aa  171  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  38.02 
 
 
348 aa  170  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  39.26 
 
 
365 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  36.16 
 
 
415 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  36.01 
 
 
459 aa  168  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  33.89 
 
 
304 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.77 
 
 
413 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  36.08 
 
 
302 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  38.56 
 
 
369 aa  167  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  35.51 
 
 
880 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  33.55 
 
 
304 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>