297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3340 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
369 aa  773    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  48.78 
 
 
379 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  41.18 
 
 
521 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  38.58 
 
 
330 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  42.19 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  38.2 
 
 
346 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  37.18 
 
 
334 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.96 
 
 
367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  35.85 
 
 
353 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  35.65 
 
 
333 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  36.45 
 
 
335 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  37.22 
 
 
328 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  36.39 
 
 
358 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 
768 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  36.68 
 
 
339 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.48 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 
330 aa  195  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  42.5 
 
 
344 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.81 
 
 
431 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  42.13 
 
 
331 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  36.51 
 
 
333 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  36.51 
 
 
333 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  42.08 
 
 
344 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  42.08 
 
 
344 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  42.08 
 
 
344 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  36.51 
 
 
333 aa  192  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  36.18 
 
 
333 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  42.08 
 
 
333 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  34.7 
 
 
352 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 
377 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  36.39 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  35.95 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  41.49 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  36.2 
 
 
343 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  35.42 
 
 
342 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  34.94 
 
 
330 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  34.7 
 
 
333 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  33.9 
 
 
361 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  38.58 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  33.75 
 
 
371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  34.39 
 
 
352 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  37.59 
 
 
352 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  34.07 
 
 
355 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  34.65 
 
 
333 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.76 
 
 
626 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  34.19 
 
 
398 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  34.08 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  39.29 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  39.75 
 
 
351 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  35.53 
 
 
365 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  33.22 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  34.55 
 
 
346 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  34.32 
 
 
331 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 
352 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.15 
 
 
417 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 
353 aa  175  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.64 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  35.02 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  33.85 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  35.13 
 
 
345 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  34.87 
 
 
431 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  37.94 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  33.94 
 
 
399 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.92 
 
 
345 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 
352 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.54 
 
 
346 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  32.19 
 
 
373 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
345 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  34.42 
 
 
352 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  34.3 
 
 
594 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.79 
 
 
322 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  34.06 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  36.52 
 
 
401 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  33.44 
 
 
613 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  30.98 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 
345 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  31.34 
 
 
340 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
348 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  32.58 
 
 
341 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  32.58 
 
 
341 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.95 
 
 
473 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  32.01 
 
 
344 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  35.37 
 
 
328 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  32.48 
 
 
344 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  36.43 
 
 
314 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  34.2 
 
 
368 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 
359 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  32.87 
 
 
384 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  31.96 
 
 
346 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  35.91 
 
 
304 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  31.85 
 
 
383 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  36.26 
 
 
377 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  35.91 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 
359 aa  156  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
358 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 
348 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 
369 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  30.15 
 
 
349 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  30.68 
 
 
427 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>