More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2275 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  100 
 
 		 365 aa  763    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  48.67 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  46.84 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  40.73 
 
 		 377 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  40.94 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  39 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  40.42 
 
 		 336 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  39.54 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  43.64 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  41.19 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  38.73 
 
 		 427 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  39.94 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  41.38 
 
 		 358 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  39.43 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  36.83 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  37.36 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  36.8 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  36.39 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  35.2 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  38.92 
 
 		 352 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  36 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 		 398 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  37.25 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  37.16 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  36.13 
 
 		 399 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  37.87 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  36.12 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.68 
 
 		 626 aa  196  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  35.76 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  37.04 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  35.56 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  36.49 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  37.78 
 
 		 379 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  34.53 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  38.49 
 
 		 328 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  37.37 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  37.83 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  39.26 
 
 		 768 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  35 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  34.87 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  36.13 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  34.81 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 		 473 aa  179  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  34.04 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  38.54 
 
 		 384 aa  175  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  32.81 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  34.88 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  36.49 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.74 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  31.42 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.49 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  36.61 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  36.04 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  35.46 
 
 		 592 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  33.94 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  35.28 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  33.23 
 
 		 333 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  35.92 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  36.01 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  32.46 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  35.46 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  34.92 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  35.41 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  36.48 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.12 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  35.76 
 
 		 464 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  35.49 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.23 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  34.11 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  35.37 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  35.02 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  35.49 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  34.95 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  35.11 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  35.59 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  35.82 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  36.04 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  32.69 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 466 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 466 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 466 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 466 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 		 466 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 		 349 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>