288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0026 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
521 aa  1067    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  41.18 
 
 
369 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  40.67 
 
 
379 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  40.96 
 
 
336 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 
357 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  37.24 
 
 
330 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.94 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  35.2 
 
 
328 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  36.39 
 
 
431 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.38 
 
 
311 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  35.83 
 
 
337 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  38.52 
 
 
333 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  38.13 
 
 
333 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  35.02 
 
 
353 aa  187  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  36.16 
 
 
768 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  38.96 
 
 
333 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  37.74 
 
 
333 aa  186  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  37.74 
 
 
333 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.96 
 
 
417 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  37.75 
 
 
344 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  37.75 
 
 
344 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  37.75 
 
 
344 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  37.76 
 
 
333 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  38.59 
 
 
331 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  37.25 
 
 
344 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  36.07 
 
 
330 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  32.93 
 
 
358 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.75 
 
 
346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  34.59 
 
 
343 aa  179  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.07 
 
 
365 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  34.99 
 
 
361 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  40.08 
 
 
346 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  39.33 
 
 
346 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 
384 aa  177  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  39.3 
 
 
345 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  36.5 
 
 
334 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 
371 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  40.24 
 
 
352 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  36.07 
 
 
330 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  39.76 
 
 
358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  35.29 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  33.53 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  38.7 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  36.93 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  38.89 
 
 
346 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  39.29 
 
 
345 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  35.19 
 
 
352 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 
333 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  39.25 
 
 
343 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  37.08 
 
 
331 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  38.46 
 
 
346 aa  170  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.82 
 
 
626 aa  169  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  36.16 
 
 
352 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.59 
 
 
302 aa  169  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  33.52 
 
 
626 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  34.59 
 
 
383 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  36.48 
 
 
339 aa  167  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  32.48 
 
 
592 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.12 
 
 
398 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 
377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  33.52 
 
 
384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  34.62 
 
 
349 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  33.87 
 
 
352 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
353 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  36.4 
 
 
355 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  38.21 
 
 
314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  38.89 
 
 
335 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  33.87 
 
 
352 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  36.4 
 
 
377 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 
328 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  33.23 
 
 
360 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  35.92 
 
 
340 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  38.17 
 
 
350 aa  161  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.75 
 
 
613 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  36.89 
 
 
333 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  36.08 
 
 
607 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  35.63 
 
 
342 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  33.98 
 
 
333 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  34.39 
 
 
594 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  38.34 
 
 
347 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  37.75 
 
 
473 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  33.23 
 
 
346 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  34.56 
 
 
397 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  38.98 
 
 
332 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  38.34 
 
 
347 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  33.33 
 
 
346 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  34.27 
 
 
437 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  31.33 
 
 
395 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  35.85 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  38.56 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  31.6 
 
 
352 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
348 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  34.78 
 
 
304 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  34.78 
 
 
304 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
359 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  37.5 
 
 
459 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  37.5 
 
 
459 aa  153  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 
459 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 
616 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  38.43 
 
 
347 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>