292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4883 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 367 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  62.91 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  35.96 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 		 379 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  38.89 
 
 		 521 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  36.01 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  38.01 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  39.8 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  33.83 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  37.34 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  35.62 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  39.61 
 
 		 357 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  36.49 
 
 		 626 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  35.8 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  36.27 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  33.76 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 		 594 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  37.22 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  34.82 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.95 
 
 		 768 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  37.79 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  36.89 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  37.22 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  31.76 
 
 		 592 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  35.2 
 
 		 431 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.57 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  35.08 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  34.19 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  29.84 
 
 		 352 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  32.3 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  34.08 
 
 		 459 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  34.08 
 
 		 459 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  34.08 
 
 		 459 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  32.73 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  31.63 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  32.56 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  30.25 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  31.54 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  34.01 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.53 
 
 		 465 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  31.42 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  32.38 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  34.62 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  33.01 
 
 		 607 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  37.35 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 626 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  36.94 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  29.03 
 
 		 613 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.19 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  31.85 
 
 		 465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  31.85 
 
 		 465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  30.45 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  31.85 
 
 		 465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  33.01 
 
 		 616 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  32.19 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.19 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  33.71 
 
 		 459 aa  126  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.25 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  33.23 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  32.22 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  32.47 
 
 		 571 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  35.34 
 
 		 463 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  33.74 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  31.5 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  32.65 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.55 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  30.48 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  29.31 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  30.56 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  31.2 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  30.48 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.88 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  32.94 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  35.44 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  32.34 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.33 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  31.61 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  40.33 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.45 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  31.14 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 466 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 594 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 		 346 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 466 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 466 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  26.69 
 
 		 662 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  32.79 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  31.98 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>