291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0386 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 431 aa  892    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  51.63 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  41.38 
 
 		 598 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  39.41 
 
 		 613 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  41.34 
 
 		 594 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  40.6 
 
 		 594 aa  309  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  40.88 
 
 		 592 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  40.77 
 
 		 626 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  41.28 
 
 		 607 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  40.36 
 
 		 616 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  32.29 
 
 		 662 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  40.89 
 
 		 768 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  38.08 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  38.59 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  41.18 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  39.53 
 
 		 311 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  37.79 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  34.87 
 
 		 369 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  37.37 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  37.04 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  37.46 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  37.2 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  36.03 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  35.95 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  38.89 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  35.59 
 
 		 302 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  35.33 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  34.16 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.92 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  36.07 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  36.07 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  33.63 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  36.09 
 
 		 343 aa  156  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  32.81 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  32.92 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  34.26 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  32.83 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  32.17 
 
 		 349 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.06 
 
 		 626 aa  149  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  36.7 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.27 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  34.58 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  35.35 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  33.84 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  32.28 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  33.86 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  34 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  33.23 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  31.72 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  31.68 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  34.19 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  30.75 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  33 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  37.55 
 
 		 332 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  34.68 
 
 		 333 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  34.68 
 
 		 333 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  34.48 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  36.45 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  37.15 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  34 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  34.12 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  33.8 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 330 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  34.34 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  32.47 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  34.34 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  33.67 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.2 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.34 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  32.45 
 
 		 459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  32.45 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  34.77 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  32.45 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  33.33 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  33.78 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  33 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  33 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  33.33 
 
 		 341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  34.71 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  32.32 
 
 		 330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  31.65 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  33.22 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  31.69 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>