293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2684 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
330 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  84.85 
 
 
330 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  84.14 
 
 
330 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  77.74 
 
 
333 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  78.05 
 
 
333 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  77.74 
 
 
333 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  76.83 
 
 
333 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  75.76 
 
 
333 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  75 
 
 
344 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  75 
 
 
344 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  75 
 
 
344 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  74.7 
 
 
344 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  62.69 
 
 
333 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  62.38 
 
 
331 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  61.83 
 
 
339 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  61.76 
 
 
371 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  61.39 
 
 
333 aa  421  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  62.3 
 
 
353 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  59.13 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  61.24 
 
 
355 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  60.52 
 
 
352 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  60.12 
 
 
331 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  60.59 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  58.46 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  63.07 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  59.62 
 
 
384 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  52.38 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  48.6 
 
 
386 aa  326  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  54.95 
 
 
349 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  50.8 
 
 
346 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  52.6 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  47.97 
 
 
345 aa  315  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  54.01 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  48.88 
 
 
346 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  52.38 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  51.03 
 
 
345 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  50.51 
 
 
346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  50.17 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  50.34 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  50.51 
 
 
346 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  50.34 
 
 
345 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  47.6 
 
 
348 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  46.8 
 
 
359 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  50.34 
 
 
346 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  50.67 
 
 
347 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  47.02 
 
 
341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  47.02 
 
 
341 aa  288  7e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  48.85 
 
 
347 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  48.85 
 
 
347 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  45.48 
 
 
344 aa  276  5e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  46.76 
 
 
346 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  46.21 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  51.11 
 
 
304 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  51.11 
 
 
304 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  45.94 
 
 
334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  46.98 
 
 
335 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  45.73 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  47.67 
 
 
464 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  45.94 
 
 
338 aa  262  4.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  45.33 
 
 
473 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  44.92 
 
 
328 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  47.28 
 
 
459 aa  260  3e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  45.48 
 
 
437 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  48.16 
 
 
397 aa  258  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  43.67 
 
 
342 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  44.44 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  43.93 
 
 
343 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  45.18 
 
 
306 aa  250  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  45.12 
 
 
465 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  45.12 
 
 
465 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  45.12 
 
 
465 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.78 
 
 
465 aa  245  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  45.12 
 
 
466 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  44.78 
 
 
465 aa  245  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.78 
 
 
465 aa  245  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.78 
 
 
465 aa  245  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  46.53 
 
 
459 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  46.53 
 
 
459 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  46.53 
 
 
459 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  44.78 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  44.78 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  44.44 
 
 
466 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  39.7 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  44.44 
 
 
466 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  40.72 
 
 
317 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  43.6 
 
 
332 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  40.58 
 
 
357 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  43.1 
 
 
463 aa  235  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  41.87 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  43.25 
 
 
324 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  40.62 
 
 
351 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  44 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  36.88 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  37.67 
 
 
353 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.63 
 
 
336 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2106  cytochrome-c peroxidase  35.1 
 
 
349 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 
332 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  35.95 
 
 
369 aa  190  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.35 
 
 
768 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  34.15 
 
 
325 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>