274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2943 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  100 
 
 		 332 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  93.07 
 
 		 332 aa  593  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  74.52 
 
 		 314 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  57.19 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  50.17 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  49.19 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  44.48 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  44.48 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  46.1 
 
 		 473 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  44.18 
 
 		 464 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  44.23 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  45.55 
 
 		 437 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  45.33 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  43.49 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  40.92 
 
 		 459 aa  249  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  42.9 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  45.1 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.91 
 
 		 465 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  43.6 
 
 		 330 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  43.94 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  42.57 
 
 		 465 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  42.57 
 
 		 465 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.57 
 
 		 465 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  42.57 
 
 		 465 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  43.94 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  42.57 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  43.32 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  43.6 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.57 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 344 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  40.38 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  42.09 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  42.09 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  40.71 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  42.09 
 
 		 466 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  44.29 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  43.16 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  42.09 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  39.74 
 
 		 344 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  41.75 
 
 		 466 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  41.75 
 
 		 466 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  41.75 
 
 		 466 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  43.77 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  42.27 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  44.22 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  41.41 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  42.37 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  42.09 
 
 		 463 aa  238  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  42.12 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  42.07 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  44.86 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  43.29 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  44.03 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  42.41 
 
 		 353 aa  232  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  40.76 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  42.76 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  44.16 
 
 		 351 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  40.91 
 
 		 306 aa  229  7e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  41.16 
 
 		 346 aa  225  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  41.78 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  41.36 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  39.2 
 
 		 349 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  38.96 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  43.53 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2106  cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  37.46 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  38.01 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  38.23 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  42.75 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  39.69 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  43.12 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  43.12 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  37.77 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  43.84 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  40.88 
 
 		 346 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  41 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  42.75 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  41.98 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  40.51 
 
 		 346 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  37.89 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  38.73 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  39.87 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  39.87 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  40.2 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  41.95 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  41.43 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  39.6 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  39.22 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  39.25 
 
 		 345 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  36.29 
 
 		 377 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  40.91 
 
 		 397 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06168  cytochrome c551 peroxidase  39.18 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  38.65 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  41.16 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  38.38 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  36.77 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1734  cytochrome c551 peroxidase  33.22 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.841983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  38.03 
 
 		 521 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>