More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0810 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 336 aa  702    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  48.49 
 
 		 357 aa  269  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  45.1 
 
 		 431 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  45.66 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  44.26 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  43.19 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  38.67 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 398 aa  241  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  45.32 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  41.81 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  40.93 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  42.19 
 
 		 369 aa  232  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  41.05 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  40.42 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  42.37 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  41.41 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  40.43 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  42.14 
 
 		 343 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  38.89 
 
 		 626 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  40.26 
 
 		 346 aa  219  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  43.63 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  40.07 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  39.29 
 
 		 768 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  37.89 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 352 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  40.28 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  43.93 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  38.41 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  39.25 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  40.96 
 
 		 521 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  41.3 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  38.96 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  38.64 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  37.54 
 
 		 346 aa  208  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  37.29 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  36.79 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  35.65 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 351 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  40.06 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  40 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  37.46 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  39.75 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  41.67 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  39.75 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  39.32 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  39.59 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  39.59 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  39.59 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  39.59 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  40.27 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  38.26 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  39.31 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  39.46 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  38.82 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  36.79 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  41.7 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  39.32 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  42.91 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  34.57 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.46 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  38.64 
 
 		 384 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  39.07 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  38.17 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  37.38 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  39.84 
 
 		 328 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  38.95 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  41.31 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  40.23 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  37.54 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  38.46 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  38 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  37.63 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  36.21 
 
 		 473 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  37.15 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  37.21 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  42.56 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  36.95 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  35.75 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  39.85 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  36.52 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  37.2 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 		 571 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  37.74 
 
 		 626 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  37 
 
 		 616 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  37.68 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  38.08 
 
 		 431 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  37.73 
 
 		 314 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  35.03 
 
 		 350 aa  182  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.89 
 
 		 465 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.89 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.53 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  40.56 
 
 		 417 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  39.53 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  37.88 
 
 		 607 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  36.08 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  36.13 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  36.97 
 
 		 464 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  38.49 
 
 		 465 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>