247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06168 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06168  cytochrome c551 peroxidase  100 
 
 
323 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  64.31 
 
 
325 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  48.91 
 
 
351 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  41.84 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  36.73 
 
 
322 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  38.51 
 
 
317 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  36.79 
 
 
384 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  38.95 
 
 
304 aa  202  7e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  39.8 
 
 
346 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  39.65 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  38.58 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  38.21 
 
 
306 aa  199  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  37.88 
 
 
347 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  36.64 
 
 
345 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  38.36 
 
 
346 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  40.59 
 
 
437 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 
330 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.71 
 
 
345 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  35.67 
 
 
345 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  38.89 
 
 
332 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  34.76 
 
 
343 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  37.8 
 
 
346 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  36.9 
 
 
346 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  37.64 
 
 
330 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  36.72 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  37.36 
 
 
331 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  37.04 
 
 
333 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 
346 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  38.04 
 
 
349 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  37.04 
 
 
333 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  37.78 
 
 
342 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  34.83 
 
 
352 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 
333 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  37.21 
 
 
347 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  36.67 
 
 
333 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  37.68 
 
 
340 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  37.78 
 
 
333 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  36.64 
 
 
346 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  37.21 
 
 
347 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  36.52 
 
 
352 aa  186  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  39.49 
 
 
459 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  39.49 
 
 
459 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  37.78 
 
 
332 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  39.49 
 
 
459 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  38.52 
 
 
334 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  35.51 
 
 
333 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  37.32 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  38.6 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  36.82 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 
333 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  39.56 
 
 
463 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 
344 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  35.94 
 
 
351 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  36.53 
 
 
330 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  36.96 
 
 
333 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.4 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  36.15 
 
 
350 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  38.41 
 
 
397 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  36.06 
 
 
339 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  36.15 
 
 
348 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  35.15 
 
 
359 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  38.06 
 
 
464 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 
371 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  37.59 
 
 
465 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  37.59 
 
 
465 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  37.59 
 
 
465 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.7 
 
 
335 aa  175  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.59 
 
 
465 aa  175  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  35.97 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.23 
 
 
465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.55 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  37.55 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1108  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase; CCP)  35.53 
 
 
287 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0173409  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  33.83 
 
 
341 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  36.71 
 
 
473 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  34.26 
 
 
341 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  36.56 
 
 
357 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  36.36 
 
 
466 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  36.18 
 
 
459 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  36.36 
 
 
466 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
466 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  36 
 
 
466 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
466 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  37.13 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  33.81 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  36.8 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.78 
 
 
377 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  34.43 
 
 
344 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  33.21 
 
 
330 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  33.7 
 
 
332 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  33.23 
 
 
346 aa  156  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  34.13 
 
 
342 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  30.92 
 
 
386 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1483  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  33.95 
 
 
299 aa  153  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0307027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2106  cytochrome-c peroxidase  32.27 
 
 
349 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 
338 aa  151  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  33.46 
 
 
324 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>