295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0812 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
334 aa  692    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  74.38 
 
 
335 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  45.05 
 
 
333 aa  292  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  44.58 
 
 
349 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  44.02 
 
 
352 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  42.26 
 
 
348 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  43.15 
 
 
346 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  45.1 
 
 
343 aa  271  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  46.2 
 
 
340 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  45.42 
 
 
333 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  42.56 
 
 
352 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  42.17 
 
 
346 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  42.23 
 
 
358 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  45.94 
 
 
330 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  45.55 
 
 
330 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  42.56 
 
 
346 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  46.13 
 
 
333 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  45.58 
 
 
333 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  45.58 
 
 
333 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  46.79 
 
 
351 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  41.23 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  45.42 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  47.35 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  45.23 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  42.9 
 
 
333 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  42.11 
 
 
345 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  45.93 
 
 
350 aa  265  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  45.58 
 
 
344 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  45.08 
 
 
331 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  42.27 
 
 
345 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  45.33 
 
 
352 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  43.33 
 
 
330 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.64 
 
 
345 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  45.23 
 
 
344 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  45.23 
 
 
344 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  45.23 
 
 
344 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  41.37 
 
 
359 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  43 
 
 
333 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  43.89 
 
 
353 aa  262  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  43.42 
 
 
355 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  40.6 
 
 
346 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  43.34 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  42.81 
 
 
347 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  43.75 
 
 
347 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  43.75 
 
 
347 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  42.03 
 
 
342 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  41.32 
 
 
346 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  40.69 
 
 
346 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  42.66 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  37.24 
 
 
369 aa  235  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  44.95 
 
 
344 aa  232  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  40.69 
 
 
377 aa  232  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  45.26 
 
 
341 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  41.69 
 
 
336 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  38.35 
 
 
346 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  44.91 
 
 
341 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  39.33 
 
 
322 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  38.87 
 
 
353 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  43.4 
 
 
344 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  35.83 
 
 
386 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  38.54 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  37.97 
 
 
304 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  44.06 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  41.72 
 
 
465 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.72 
 
 
465 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  41.72 
 
 
465 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  41.72 
 
 
465 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  41.72 
 
 
465 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.72 
 
 
465 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.72 
 
 
465 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  37.63 
 
 
304 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  41.37 
 
 
338 aa  208  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  35.8 
 
 
328 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  38.33 
 
 
333 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  39.87 
 
 
463 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  35.45 
 
 
325 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  39.04 
 
 
768 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  37.8 
 
 
328 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  37.54 
 
 
459 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  37.54 
 
 
459 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  37.54 
 
 
459 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  37.88 
 
 
437 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  38.64 
 
 
314 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  38.59 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  38.59 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  38.59 
 
 
466 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  38.59 
 
 
466 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  38.59 
 
 
466 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  41.81 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  38.49 
 
 
302 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  37.92 
 
 
459 aa  199  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  37.15 
 
 
358 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  38.36 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  39.15 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  36.2 
 
 
431 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  37.88 
 
 
324 aa  195  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  36.79 
 
 
306 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  36.45 
 
 
464 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  35.99 
 
 
337 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>