297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2895 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 352 aa  713    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  84.09 
 
 		 352 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  84.09 
 
 		 352 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  47.02 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  48.16 
 
 		 358 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  50 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  44.1 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  41.03 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  43.43 
 
 		 302 aa  232  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  39.25 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  37.58 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  39.61 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  37.22 
 
 		 768 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  36.12 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  34.88 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  38.11 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  37.76 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  37.58 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  37.76 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.63 
 
 		 626 aa  169  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  34.34 
 
 		 383 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  35.28 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  36.89 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  33.22 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  32.66 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 		 431 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  35.43 
 
 		 592 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  32.32 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  31.63 
 
 		 598 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  32.96 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  31.6 
 
 		 521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  32.39 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.42 
 
 		 626 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  33.52 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  29.56 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  30.52 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  30.4 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  30.36 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  29.94 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  29.41 
 
 		 613 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  34.9 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  37.87 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  33.65 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  30.87 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  31.6 
 
 		 571 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  32.37 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.38 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.22 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  31.95 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  31.43 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.43 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  29.04 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  32.15 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 		 594 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  28.24 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  32.74 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  36.45 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  32.34 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  32.57 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  30.09 
 
 		 357 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  31.16 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  30.9 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  31.62 
 
 		 417 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  33.56 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  32 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  32.17 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  29.47 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  29.79 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  32.72 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  37.29 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  29.97 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  33.45 
 
 		 607 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  31.02 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  30.56 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.55 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  30.36 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  31.15 
 
 		 594 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  32.13 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  30.5 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  30.99 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  30.65 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  30.06 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  29.81 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  29.81 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  32.87 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  29.5 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  30.82 
 
 		 616 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  30.38 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>