295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2680 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
594 aa  1223    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  42.76 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  40.6 
 
 
598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  40.88 
 
 
607 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  40.14 
 
 
616 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  37.46 
 
 
592 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  41.91 
 
 
626 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  36.4 
 
 
571 aa  336  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  36.79 
 
 
613 aa  330  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  41.34 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  28.91 
 
 
662 aa  207  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  34.94 
 
 
369 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  32.59 
 
 
768 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  34.68 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  31.8 
 
 
343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.79 
 
 
353 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  30.55 
 
 
431 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 
352 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 
333 aa  143  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.44 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  32.65 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  31.15 
 
 
352 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.24 
 
 
357 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.24 
 
 
302 aa  140  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  32.21 
 
 
336 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 
352 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 
328 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.09 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  31.49 
 
 
626 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  33.71 
 
 
379 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  31.56 
 
 
334 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  35.16 
 
 
332 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  31.38 
 
 
365 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 
346 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  32.31 
 
 
360 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  31.29 
 
 
337 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.94 
 
 
521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  28.99 
 
 
365 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  31.08 
 
 
398 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  35.16 
 
 
332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
473 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  32.03 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  30.58 
 
 
398 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.01 
 
 
361 aa  127  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  31.88 
 
 
353 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  29.49 
 
 
330 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  31.15 
 
 
351 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  31.33 
 
 
333 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 
344 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  33.98 
 
 
314 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 
344 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  31.67 
 
 
333 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 
344 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  29.38 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  30.86 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.47 
 
 
437 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  32.25 
 
 
365 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  31.33 
 
 
333 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 
344 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  31.33 
 
 
333 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  31.33 
 
 
333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  30.99 
 
 
349 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  31.96 
 
 
377 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  29.16 
 
 
427 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 
330 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  31.17 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  30.98 
 
 
384 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.32 
 
 
367 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  29.67 
 
 
317 aa  118  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  31.02 
 
 
330 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  29.74 
 
 
399 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  31.68 
 
 
330 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  32.56 
 
 
331 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  32.91 
 
 
348 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  29.93 
 
 
340 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 
322 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.24 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  32.57 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  30.79 
 
 
352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  30.16 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  31.7 
 
 
330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  29.43 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  30.56 
 
 
459 aa  115  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  31.46 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  31.2 
 
 
324 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0738  hypothetical protein  29.86 
 
 
334 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  hitchhiker  0.000000498212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 
333 aa  113  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  29.26 
 
 
368 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  30.67 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.78 
 
 
346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.2 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  30.98 
 
 
361 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  30.87 
 
 
342 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  28.62 
 
 
352 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  28.76 
 
 
304 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 
369 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.49 
 
 
346 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 
397 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>