289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3035 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
401 aa  812    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2428  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.97 
 
 
358 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.33496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  41.04 
 
 
360 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  41.8 
 
 
357 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  35.47 
 
 
377 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  36.78 
 
 
341 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  37.78 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  37.05 
 
 
395 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 
359 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  38.46 
 
 
336 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  32.59 
 
 
345 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  34.32 
 
 
369 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  36.41 
 
 
399 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 
347 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  38.14 
 
 
348 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  36.52 
 
 
369 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  37.39 
 
 
368 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  35.96 
 
 
431 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  34.8 
 
 
379 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  35.17 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  34.48 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  36.67 
 
 
626 aa  162  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  34.76 
 
 
398 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.96 
 
 
311 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  34.24 
 
 
343 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
365 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  32.85 
 
 
373 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  36.59 
 
 
398 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  35.28 
 
 
365 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  32.27 
 
 
401 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.23 
 
 
346 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  36.14 
 
 
353 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.59 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  36.66 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  35.24 
 
 
358 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 
768 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  31.12 
 
 
365 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 
398 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  32.96 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 
594 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  35.29 
 
 
353 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.37 
 
 
613 aa  136  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.03 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  32.35 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  30.87 
 
 
521 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  35.53 
 
 
334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  32.37 
 
 
330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
308 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  32.49 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.84 
 
 
302 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.43 
 
 
297 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  29.58 
 
 
384 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  33.43 
 
 
343 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  32.04 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.27 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  31.35 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  30.86 
 
 
594 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  31.46 
 
 
607 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  32.05 
 
 
571 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  32.4 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 
598 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  31.19 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.46 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  31.13 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  31.09 
 
 
333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
352 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  32.96 
 
 
335 aa  116  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  30.17 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.53 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.83 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  30.43 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 
333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  30.43 
 
 
304 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  31.86 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  31.49 
 
 
333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.98 
 
 
416 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.91 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  31.7 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.66 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  32.05 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  32.05 
 
 
344 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  32.05 
 
 
344 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  32.05 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  30.98 
 
 
409 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  32.68 
 
 
331 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.91 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  33.66 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  32.68 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  33.58 
 
 
346 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  30.82 
 
 
346 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
371 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  32.18 
 
 
339 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>