284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1885 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 416 aa  866    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  40.92 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  41.43 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  40.36 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.36 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  31.45 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.33 
 
 		 626 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  29.27 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.17 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  30.13 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.87 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  31.01 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.14 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  29.44 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  30.81 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  28.69 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4030  beta strand repeat-containing protein  34.8 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  27.75 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.69 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  27.98 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  29.12 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  28.07 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.18 
 
 		 334 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  27.35 
 
 		 598 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  27.61 
 
 		 328 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  28.49 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  27.94 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  27.79 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  29.82 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  27.97 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  27.35 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  27.3 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.21 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  28.98 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  29.56 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.39 
 
 		 768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  25.97 
 
 		 333 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  26.73 
 
 		 521 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  24.59 
 
 		 304 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  29.23 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  29.78 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  25.56 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  28.53 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  26.81 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  28.9 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  26.11 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  28.96 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  24.59 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  27.09 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  26.63 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  26.21 
 
 		 347 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.48 
 
 		 613 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  25.48 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.82 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  30.13 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  28.46 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  26.72 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  24.25 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.79 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  27.22 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  25.87 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  24.81 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  24.7 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  26.46 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  26.06 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  26.08 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.46 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.46 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.46 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  26.33 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 626 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  27.46 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  25.59 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  27.12 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  26.12 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  25.78 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  25.78 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  27.25 
 
 		 343 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  26.3 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  28.88 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  27.46 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  27.65 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  26.03 
 
 		 616 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  26.92 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  26.59 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  25.78 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  25.8 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  26.27 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.29 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  25.51 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  26.18 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  26.18 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  26.18 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  24.86 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  23.66 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.65 
 
 		 594 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>