289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3462 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
361 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  61.39 
 
 
367 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 
379 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.24 
 
 
369 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 
521 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  38.71 
 
 
431 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  34.13 
 
 
330 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.37 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.86 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  37.46 
 
 
357 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  33.67 
 
 
343 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.75 
 
 
346 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.77 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  36.63 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 
337 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  36.96 
 
 
348 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  32.59 
 
 
768 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  35.62 
 
 
353 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.72 
 
 
626 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  29.56 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  30.79 
 
 
365 aa  135  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  29.79 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  30.64 
 
 
359 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  31.65 
 
 
333 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.81 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  35.8 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  30.3 
 
 
328 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.6 
 
 
594 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  34 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  30.72 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  31.34 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  29.9 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  32.69 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  32.24 
 
 
401 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  32.41 
 
 
464 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  36.83 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  31.52 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  30.24 
 
 
360 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  29.25 
 
 
592 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  30.8 
 
 
459 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 
417 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 
333 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  30.8 
 
 
459 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  30.67 
 
 
473 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  30.16 
 
 
352 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  30.8 
 
 
459 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  35.24 
 
 
352 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  35.64 
 
 
352 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 
607 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  31.82 
 
 
437 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  31.56 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  30.07 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 
594 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.04 
 
 
465 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 
344 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  30.33 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.04 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  32.78 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  31.54 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  31.69 
 
 
465 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  31.69 
 
 
465 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.8 
 
 
465 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  31.8 
 
 
465 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  31.69 
 
 
465 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  31.12 
 
 
341 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  30.83 
 
 
352 aa  119  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 
571 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  32.18 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  31.92 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  30.65 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.3 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  36.51 
 
 
347 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  33.61 
 
 
346 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  36.51 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  31.71 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  32.27 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32 
 
 
330 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  31.69 
 
 
371 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  28.26 
 
 
345 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  31.15 
 
 
325 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  30.92 
 
 
466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  30.92 
 
 
466 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  30.92 
 
 
466 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  30.92 
 
 
466 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.84 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  30.52 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  27.87 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  32.65 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.01 
 
 
626 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  32.27 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  30.18 
 
 
333 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  29.71 
 
 
616 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>