290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4460 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 345 aa  727    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  56.66 
 
 		 365 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  53.75 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  54.27 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  52.08 
 
 		 341 aa  355  8.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  52.23 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  53.16 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  46.15 
 
 		 352 aa  322  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  37.57 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  41.19 
 
 		 365 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  40.49 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.95 
 
 		 353 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.68 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  35.03 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  31.75 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  35.76 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  34.93 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.66 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  33.91 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  36.29 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 		 369 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  35.47 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  32.85 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  34.42 
 
 		 352 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.12 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.56 
 
 		 473 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  36.45 
 
 		 464 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  33.91 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  30.23 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  31.05 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  31.76 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  30.95 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.55 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.27 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  32.47 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.98 
 
 		 626 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  34.74 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  35.27 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  29.94 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  31.96 
 
 		 768 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  29.94 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.36 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  32.69 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  34.72 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  34.72 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  30.61 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  31.52 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  32.4 
 
 		 371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  32.77 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2428  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.89 
 
 		 358 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.33496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.55 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  34.39 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  30.89 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  31.43 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.53 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  30.67 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  33.45 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.01 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 344 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.68 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  30.81 
 
 		 348 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  32.62 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  29.5 
 
 		 398 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  31.2 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32.01 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  32.56 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  33.98 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  32.39 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.06 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  34.84 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  32.64 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.59 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  31.65 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.99 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  33.86 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  31.13 
 
 		 521 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  31.29 
 
 		 347 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  32.64 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  32.21 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  32.21 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.21 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  34.45 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  32.21 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  32.21 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  31.55 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  33.21 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  31.67 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  29.79 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>