More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7510 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 358 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  51.44 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  52.09 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  53.38 
 
 		 353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  51.16 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  46.97 
 
 		 352 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  46.34 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  48.16 
 
 		 352 aa  292  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  45.21 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  45.93 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  44.26 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  39.62 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  43.19 
 
 		 357 aa  228  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  41.3 
 
 		 768 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  41.38 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  36.39 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  39.86 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  38 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  37.42 
 
 		 626 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  37.06 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  37.84 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  37.79 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  33.52 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  37.3 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  37.54 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  36.82 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  37.22 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  36.81 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  37.03 
 
 		 592 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 521 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  37.8 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  35.63 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  36.13 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  38.59 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  37.33 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  37.72 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  33.98 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  33.75 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  35.28 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  35.16 
 
 		 349 aa  175  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  33.53 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  35.92 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  34.32 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  35.15 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.36 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.89 
 
 		 626 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 598 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.19 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  34.46 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  35.23 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  34.19 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 		 571 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  35.57 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  33.04 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  35.43 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  35.4 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  33.04 
 
 		 341 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  34.16 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  36.52 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  35.05 
 
 		 333 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  34.36 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  35.52 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  34.59 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  34.59 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.95 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  34.71 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  32.21 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  34.55 
 
 		 377 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  34.59 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  34.36 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  33.97 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  34.71 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  35.99 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  31.12 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.36 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  33.66 
 
 		 594 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  33.44 
 
 		 613 aa  162  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  32.41 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  33.45 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  35.84 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  33.13 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  35.42 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  33.79 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  35.66 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  36.16 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  31.53 
 
 		 399 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  33.82 
 
 		 607 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  34.85 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  34.03 
 
 		 352 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  33.11 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  36.11 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  33.12 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  34.83 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>