299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4161 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
598 aa  1247    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  40.95 
 
 
594 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  42.03 
 
 
616 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  40.6 
 
 
594 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  41.04 
 
 
626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  40.25 
 
 
607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  40.07 
 
 
592 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  36.17 
 
 
613 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  41.38 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  36.22 
 
 
571 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  28.39 
 
 
662 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  37.62 
 
 
768 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.14 
 
 
336 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.77 
 
 
365 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.22 
 
 
358 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  35.57 
 
 
335 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 
334 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  37.05 
 
 
357 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  34.77 
 
 
398 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
346 aa  161  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  32.27 
 
 
352 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 
427 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  31.63 
 
 
352 aa  160  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  33 
 
 
328 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.18 
 
 
417 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  35.81 
 
 
352 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.94 
 
 
626 aa  157  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 
352 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  35.57 
 
 
346 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.84 
 
 
398 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 
365 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.76 
 
 
431 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  32.35 
 
 
343 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 
346 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  31.65 
 
 
333 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  35.88 
 
 
346 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.98 
 
 
353 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 
369 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  32.18 
 
 
369 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  32.23 
 
 
337 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
349 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  31.11 
 
 
521 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 
390 aa  147  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  34.42 
 
 
459 aa  147  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 
384 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 
302 aa  145  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  32.78 
 
 
345 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  33.67 
 
 
358 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
473 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 
330 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  35.69 
 
 
330 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.39 
 
 
440 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
340 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  33.99 
 
 
459 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  33.99 
 
 
459 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  33.99 
 
 
459 aa  140  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.09 
 
 
322 aa  140  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  34.64 
 
 
343 aa  139  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  31 
 
 
357 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.11 
 
 
379 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
333 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 
397 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
311 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  32.32 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  31.05 
 
 
346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.33 
 
 
333 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
331 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  31.99 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  31.99 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  32.45 
 
 
347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 
466 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  31.99 
 
 
466 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  32.12 
 
 
464 aa  134  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  30.43 
 
 
346 aa  134  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.01 
 
 
384 aa  134  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
333 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  33 
 
 
333 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  30.98 
 
 
463 aa  133  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  31.31 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
345 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  33 
 
 
333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  32.36 
 
 
348 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  31.65 
 
 
465 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  31.65 
 
 
465 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  31.65 
 
 
465 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  33.77 
 
 
347 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  31.65 
 
 
465 aa  132  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.65 
 
 
465 aa  132  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 
360 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 
347 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.65 
 
 
465 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.65 
 
 
465 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  31.42 
 
 
344 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  32.35 
 
 
314 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  31.42 
 
 
344 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  30.77 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>