284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5043 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 
440 aa  892    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  37.1 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  38.58 
 
 
409 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  38.48 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.36 
 
 
416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  33.61 
 
 
336 aa  177  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.15 
 
 
431 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.84 
 
 
358 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.35 
 
 
346 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  32.37 
 
 
768 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
398 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  31.39 
 
 
598 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.22 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  30.49 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.25 
 
 
328 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.08 
 
 
337 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 
302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  28.91 
 
 
346 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 
353 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  28.68 
 
 
379 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  26.84 
 
 
365 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  30.99 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  28.05 
 
 
343 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  30.96 
 
 
616 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
352 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.35 
 
 
431 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  31.62 
 
 
335 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.96 
 
 
626 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  26.32 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  28.92 
 
 
399 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  28.34 
 
 
417 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 
311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  27.75 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 
607 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4030  beta strand repeat-containing protein  35.06 
 
 
261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  27.76 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.9 
 
 
626 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  27.86 
 
 
369 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  29.37 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  27.91 
 
 
383 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  26.28 
 
 
345 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  29.35 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  28.39 
 
 
473 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  27.65 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  26.53 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  26.7 
 
 
357 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  25.74 
 
 
398 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  28.95 
 
 
571 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  29.32 
 
 
427 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  26.4 
 
 
359 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.37 
 
 
613 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  27.57 
 
 
464 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  28.13 
 
 
348 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  26.1 
 
 
346 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 
459 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 
349 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  25.45 
 
 
352 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  27.25 
 
 
463 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  28.53 
 
 
371 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  26.33 
 
 
346 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  28.06 
 
 
345 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  26.61 
 
 
346 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  25.87 
 
 
592 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  29.26 
 
 
352 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  27.04 
 
 
401 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  26.8 
 
 
365 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  28.38 
 
 
331 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  26.98 
 
 
395 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  25.86 
 
 
377 aa  100  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  28.45 
 
 
384 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  30.03 
 
 
437 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  27.12 
 
 
359 aa  99.8  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  27.61 
 
 
368 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.3 
 
 
346 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.02 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  26.91 
 
 
521 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  27.4 
 
 
331 aa  98.2  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  28.27 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  27.13 
 
 
342 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
344 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  27.32 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  28 
 
 
314 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
344 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  26.45 
 
 
358 aa  96.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  27.99 
 
 
339 aa  96.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  26.2 
 
 
350 aa  96.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  26.82 
 
 
345 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  29.05 
 
 
401 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  27.34 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 
328 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  28.78 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  27.03 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  27.34 
 
 
347 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  26.85 
 
 
361 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>