292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2381 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  67 
 
 
607 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
616 aa  1271    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  45.03 
 
 
626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  43.51 
 
 
594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  42.03 
 
 
598 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  41.39 
 
 
592 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  38.89 
 
 
594 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  36.02 
 
 
571 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  34.67 
 
 
613 aa  321  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  40.36 
 
 
431 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  27.71 
 
 
662 aa  220  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  38.76 
 
 
768 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.67 
 
 
336 aa  189  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  37.73 
 
 
417 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  35.29 
 
 
343 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 
346 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  35.97 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.85 
 
 
365 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.76 
 
 
626 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  34.44 
 
 
358 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  34.54 
 
 
311 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 
333 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  33.98 
 
 
328 aa  160  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  34.55 
 
 
384 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  32.45 
 
 
328 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  34.73 
 
 
473 aa  156  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  34.85 
 
 
317 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  36.33 
 
 
332 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 
431 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  34.38 
 
 
464 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  37.94 
 
 
357 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  32.83 
 
 
521 aa  154  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  35.55 
 
 
332 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  35.69 
 
 
459 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  35.69 
 
 
459 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  35.69 
 
 
459 aa  151  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
352 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  35.66 
 
 
314 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  31.53 
 
 
337 aa  150  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.15 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  36.15 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.15 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.15 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.75 
 
 
346 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  33.12 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  35.77 
 
 
465 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  35.77 
 
 
465 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  35.77 
 
 
465 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 
335 aa  146  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  34.5 
 
 
344 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  34.5 
 
 
344 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  34.5 
 
 
344 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  34.5 
 
 
344 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  36.02 
 
 
333 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
331 aa  143  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  35.63 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  33.98 
 
 
330 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  35.63 
 
 
333 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  35.63 
 
 
333 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.52 
 
 
369 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 
334 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  34.62 
 
 
466 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  34.62 
 
 
466 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  34.62 
 
 
466 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  34.62 
 
 
466 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  34.62 
 
 
466 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  35.07 
 
 
344 aa  140  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  32.24 
 
 
352 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  34.07 
 
 
322 aa  140  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  34.87 
 
 
333 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  35.74 
 
 
371 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  34 
 
 
437 aa  140  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  33.04 
 
 
360 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 
330 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  33.81 
 
 
463 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  34.07 
 
 
346 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  32.38 
 
 
346 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  31.43 
 
 
368 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  35.79 
 
 
343 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.24 
 
 
352 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  35.32 
 
 
357 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 
399 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.68 
 
 
302 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  31.15 
 
 
352 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  33.89 
 
 
333 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  33.12 
 
 
358 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  33.54 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 
330 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0738  hypothetical protein  32.17 
 
 
334 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  hitchhiker  0.000000498212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  32.43 
 
 
346 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  30.62 
 
 
365 aa  134  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  35.38 
 
 
341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  35.38 
 
 
341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  32.37 
 
 
345 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  31.2 
 
 
373 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  33.1 
 
 
345 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  33.08 
 
 
352 aa  130  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>