264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0005 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 401 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  71.39 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  49.1 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  48.93 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  44.92 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  48.32 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  44.66 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  46.67 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  39.24 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  38.07 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  37.22 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.08 
 
 		 297 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  35.14 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  36.21 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  36.67 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  36.39 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.91 
 
 		 626 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  33.08 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  33.16 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  30.81 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  32.65 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  34.32 
 
 		 360 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 		 768 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.87 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.73 
 
 		 358 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  29.44 
 
 		 352 aa  153  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  32.27 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.56 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  29.44 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  31.52 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  33.53 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.67 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  31.52 
 
 		 368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  32.37 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  29.95 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.12 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  30.96 
 
 		 521 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  31.09 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.01 
 
 		 431 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  30.51 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.83 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  28.24 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  30.06 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.1 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  29.78 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  31.12 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  31.52 
 
 		 343 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  32.73 
 
 		 459 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  32.73 
 
 		 459 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  32.73 
 
 		 459 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  29.82 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  30.28 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  32.42 
 
 		 594 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  31.8 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  29.22 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  30.61 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  29.53 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  29.78 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  30.51 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.9 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  30.51 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  27.55 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  29.76 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  31.93 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  28.53 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.11 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  32.12 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  28.27 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.31 
 
 		 302 aa  123  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  31.18 
 
 		 459 aa  122  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  28.84 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  27.95 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  28.92 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  26.21 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  30.27 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.83 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  30.27 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  30.27 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  30.27 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  30.27 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  30.92 
 
 		 592 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  29.91 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  31.49 
 
 		 465 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  31.49 
 
 		 465 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  31.49 
 
 		 465 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  30.91 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.49 
 
 		 465 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.43 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.75 
 
 		 322 aa  116  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  31.49 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.49 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  30.7 
 
 		 571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>