270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0005 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 395 aa  820    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  71.39 
 
 		 401 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  50.89 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  51.53 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  50.13 
 
 		 398 aa  348  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  48.35 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  46.96 
 
 		 369 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  45.96 
 
 		 398 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  41.46 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  38.64 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  37.85 
 
 		 308 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  39.83 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  35.64 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  35.56 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  37.21 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  35.2 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.61 
 
 		 297 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  37.05 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  37.25 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  36.63 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  36.15 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.83 
 
 		 626 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  36.73 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  34.93 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  31.66 
 
 		 373 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  32.94 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  33.97 
 
 		 768 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.95 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.24 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  33.63 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  31 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  31.33 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  31.71 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  29.56 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  31.42 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  30.77 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  32.06 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.25 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  34.13 
 
 		 594 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.16 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  31.09 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.44 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.86 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  31.67 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  29.39 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  32.18 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.76 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  33.79 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  31.62 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  30.27 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  32.62 
 
 		 571 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  31.71 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  30.37 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.55 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  29.9 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  31.18 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  30.88 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  29.82 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  31.18 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  29.71 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  30.19 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  29.45 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  29.21 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  29.48 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  31.85 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.27 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  29.62 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32.42 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  30.33 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  29.74 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.01 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  32.12 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  31.76 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.66 
 
 		 613 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  31.75 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  31.88 
 
 		 459 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  32.25 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  32.42 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.03 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  30.48 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  28.99 
 
 		 359 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  30.98 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  27.25 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>