296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0101 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 348 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  40.46 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  40.95 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  42.22 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  39.06 
 
 		 359 aa  239  6.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  39.31 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  40 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  37.33 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  40.76 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  42.44 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  38.3 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  36.69 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  38.35 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  39.81 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  33.25 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  39.45 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  37.67 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.14 
 
 		 626 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  37.1 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  37.87 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  33.08 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 369 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  37.76 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  36.76 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  36.04 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  37.46 
 
 		 401 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  35.59 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  35.65 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  35.87 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  37.38 
 
 		 768 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  32.85 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  31.79 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  37.42 
 
 		 626 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.78 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  34.72 
 
 		 427 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  35.56 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.97 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  36.14 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.51 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  36.43 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  35.01 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  36.71 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  34.39 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.74 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  35.83 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  34.92 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  35.56 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  35 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  31.95 
 
 		 594 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  38.06 
 
 		 521 aa  152  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  34.21 
 
 		 459 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  34.21 
 
 		 459 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 459 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  36.59 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.74 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  35.11 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  35.74 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  35.89 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  32.19 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.69 
 
 		 346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.62 
 
 		 417 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  32.46 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  32.55 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  33.01 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.94 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.19 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  32.15 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  34.04 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  31.92 
 
 		 466 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  37.75 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  32 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  31.88 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  31.92 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  30.49 
 
 		 613 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  32.87 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  30.4 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  31.92 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  31.92 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  30.89 
 
 		 384 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.99 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  29.91 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  30.89 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  31.37 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  31.89 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 607 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  28.89 
 
 		 345 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  31.63 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>