298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09198 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  100 
 
 
613 aa  1253    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  36.17 
 
 
598 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  34.19 
 
 
626 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  36.7 
 
 
594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  37.08 
 
 
594 aa  313  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  39.41 
 
 
431 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 
616 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  35.39 
 
 
571 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 
592 aa  296  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  35.23 
 
 
607 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  31.21 
 
 
662 aa  220  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  37.97 
 
 
768 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 
353 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 
431 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  35.53 
 
 
328 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  35.18 
 
 
357 aa  166  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 
369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
333 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 
311 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 
336 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.44 
 
 
358 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  34.5 
 
 
377 aa  161  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.31 
 
 
365 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  31.75 
 
 
521 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  34.3 
 
 
330 aa  160  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
398 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 
360 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  35.14 
 
 
330 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  31.54 
 
 
337 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 
302 aa  153  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
346 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
359 aa  151  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.54 
 
 
626 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  30.47 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  31.78 
 
 
365 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  32.59 
 
 
379 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.57 
 
 
346 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  31.94 
 
 
333 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 
352 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  31.23 
 
 
333 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  30.72 
 
 
352 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  30.91 
 
 
333 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 
344 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  32.45 
 
 
346 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  30.6 
 
 
333 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 
344 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  30.6 
 
 
333 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 
344 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 
344 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  30.39 
 
 
352 aa  144  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  32.42 
 
 
459 aa  143  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  31.13 
 
 
390 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  31.68 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  29.32 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
335 aa  142  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 
347 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  32.23 
 
 
331 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  32.73 
 
 
427 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.13 
 
 
473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 
341 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  31.21 
 
 
348 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  31.37 
 
 
401 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 
334 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  30.84 
 
 
365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  31.46 
 
 
331 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  31.29 
 
 
437 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  30.1 
 
 
339 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  28.41 
 
 
349 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  30.94 
 
 
352 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.74 
 
 
351 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 
368 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  30.42 
 
 
333 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  34.2 
 
 
351 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.35 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.1 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 
459 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  32.14 
 
 
459 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  32.14 
 
 
459 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.24 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  35.74 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  34.09 
 
 
365 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  29.61 
 
 
352 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  28.74 
 
 
373 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  30.86 
 
 
361 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  30.51 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  29.9 
 
 
464 aa  128  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  29.87 
 
 
345 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  28.9 
 
 
346 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
346 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  31.03 
 
 
358 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
384 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  27.48 
 
 
340 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
345 aa  124  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  31.66 
 
 
395 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  28.2 
 
 
333 aa  123  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  29.84 
 
 
328 aa  124  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  32.28 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  27.76 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>