291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1906 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 		 390 aa  805    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  45.64 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  47.15 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  46.09 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  40.89 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  42.89 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  41.3 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  42.15 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  44.51 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  41.1 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.01 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  41.34 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  35.93 
 
 		 480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.67 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  38.34 
 
 		 463 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.34 
 
 		 463 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  41.48 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  38.87 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.95 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.42 
 
 		 525 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.72 
 
 		 536 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.72 
 
 		 536 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.72 
 
 		 536 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.4 
 
 		 540 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  36.01 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.21 
 
 		 487 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  38.65 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  34.38 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  33.82 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  37.3 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  33.82 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  33.82 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  34.14 
 
 		 449 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.6 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  37.53 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  33.66 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  38.4 
 
 		 471 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  32.17 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  38.13 
 
 		 467 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.24 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.36 
 
 		 543 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.13 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.13 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.13 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  32.93 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.07 
 
 		 474 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  37.47 
 
 		 461 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  37.07 
 
 		 456 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  36.81 
 
 		 540 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.94 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.94 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.94 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.94 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.94 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  36.94 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  35.39 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.96 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  36.27 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  35.4 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  36.02 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  36.17 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  36.17 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  35.85 
 
 		 448 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  35.9 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  36.49 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.92 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  34.22 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  35.39 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  35.85 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  36.66 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.93 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.02 
 
 		 460 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  35.48 
 
 		 461 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  35.68 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  35.68 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  35.68 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.68 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.98 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  35.31 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  37.68 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1028  hypothetical protein  29.57 
 
 		 529 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743991  normal  0.0101542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  32.49 
 
 		 594 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.25 
 
 		 768 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  29.78 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.82 
 
 		 613 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  32.29 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.55 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  30.98 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.95 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  31.83 
 
 		 431 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  32.8 
 
 		 626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.92 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  31.17 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  31.84 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  32.19 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  33.15 
 
 		 626 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 		 607 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  32.68 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  29.12 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.99 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>