263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0346 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  100 
 
 
491 aa  996    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  51.79 
 
 
476 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  38.59 
 
 
428 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  40.74 
 
 
461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  39.31 
 
 
455 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.56 
 
 
525 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  39.44 
 
 
469 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  39.68 
 
 
435 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  38.8 
 
 
468 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  39.49 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.04 
 
 
536 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.03 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.04 
 
 
536 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.33 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.33 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.33 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.04 
 
 
536 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  38.55 
 
 
471 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  39.49 
 
 
449 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  39.49 
 
 
449 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.47 
 
 
536 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  39.03 
 
 
467 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  33.27 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  36.7 
 
 
441 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.72 
 
 
540 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.27 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.33 
 
 
460 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  38.03 
 
 
480 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.18 
 
 
480 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  38.8 
 
 
461 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  37.83 
 
 
473 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  37.83 
 
 
473 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  37.66 
 
 
473 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  36.82 
 
 
472 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  37.04 
 
 
449 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  36.57 
 
 
454 aa  260  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  36.6 
 
 
473 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  37.22 
 
 
472 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  36.92 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.5 
 
 
413 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.92 
 
 
468 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.93 
 
 
462 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.36 
 
 
429 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.26 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  36.32 
 
 
424 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  36.65 
 
 
454 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  33.64 
 
 
449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  35.05 
 
 
436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.57 
 
 
543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  34.97 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  34.97 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  34.81 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  34.73 
 
 
448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.15 
 
 
446 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  34.27 
 
 
458 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  33.7 
 
 
446 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.87 
 
 
474 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  33.87 
 
 
456 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  34.26 
 
 
540 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.26 
 
 
540 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.26 
 
 
540 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.26 
 
 
540 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  34.5 
 
 
448 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.26 
 
 
540 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.26 
 
 
540 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.53 
 
 
451 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  33.95 
 
 
540 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.26 
 
 
433 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  31.88 
 
 
390 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 
361 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  33.53 
 
 
353 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  29.81 
 
 
419 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  33.24 
 
 
422 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.38 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  32.49 
 
 
393 aa  133  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  31.27 
 
 
378 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  29.55 
 
 
453 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.93 
 
 
196 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  32.53 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.54 
 
 
487 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 
431 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  26.99 
 
 
431 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.56 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.7 
 
 
626 aa  94  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  25.57 
 
 
377 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.48 
 
 
328 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.44 
 
 
594 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.63 
 
 
311 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  27.5 
 
 
368 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  36.42 
 
 
220 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  27.24 
 
 
379 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  26.8 
 
 
498 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  25.99 
 
 
348 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  28.89 
 
 
437 aa  87  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  25.77 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  25.86 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  26.83 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  25.55 
 
 
613 aa  84.7  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  25.33 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  25.7 
 
 
336 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>