259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3756 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
480 aa  988    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  70.68 
 
 
480 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  65.46 
 
 
473 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  65.46 
 
 
473 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  65.46 
 
 
473 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  64.39 
 
 
473 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  64.88 
 
 
472 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  65.92 
 
 
449 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  67.13 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  64.22 
 
 
536 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  67.45 
 
 
525 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  64.78 
 
 
536 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  64.94 
 
 
540 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  64.78 
 
 
536 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  64.78 
 
 
536 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  53.06 
 
 
451 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  49.26 
 
 
454 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  50.77 
 
 
461 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  48.87 
 
 
460 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  47.75 
 
 
463 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  47.75 
 
 
463 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  43.3 
 
 
428 aa  359  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  46.72 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  48.87 
 
 
461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  47.24 
 
 
471 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  49.11 
 
 
449 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  46.98 
 
 
467 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  49.11 
 
 
449 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  49.11 
 
 
449 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.98 
 
 
471 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.98 
 
 
471 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.98 
 
 
471 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.95 
 
 
374 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  47.25 
 
 
441 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  48.74 
 
 
435 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  46.48 
 
 
468 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  48.46 
 
 
469 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  48.33 
 
 
461 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.98 
 
 
462 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.97 
 
 
429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.47 
 
 
433 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  39.44 
 
 
424 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.35 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.24 
 
 
468 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  40.24 
 
 
454 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.56 
 
 
413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  38.03 
 
 
491 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  36.63 
 
 
446 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  37.41 
 
 
448 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  38.48 
 
 
461 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  38.48 
 
 
461 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  38.48 
 
 
436 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.76 
 
 
446 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  37.16 
 
 
448 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  37.56 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.88 
 
 
543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.26 
 
 
433 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  37.97 
 
 
458 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.99 
 
 
540 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  35.99 
 
 
540 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.99 
 
 
540 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  35.99 
 
 
540 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.99 
 
 
540 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.99 
 
 
540 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.99 
 
 
540 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  34.84 
 
 
449 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.22 
 
 
474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  37.22 
 
 
456 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  36.02 
 
 
390 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  29.82 
 
 
353 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  33.11 
 
 
419 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.81 
 
 
196 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.77 
 
 
393 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  29.88 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  30.5 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  30.47 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  28.27 
 
 
453 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.56 
 
 
451 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.74 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  31.27 
 
 
387 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.85 
 
 
594 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  26.28 
 
 
346 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.09 
 
 
613 aa  106  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  29.16 
 
 
626 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  27.82 
 
 
431 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.11 
 
 
369 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.1 
 
 
417 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  26.32 
 
 
571 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 
379 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  28.88 
 
 
431 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  29.1 
 
 
616 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  27.08 
 
 
592 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  27.88 
 
 
598 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.1 
 
 
594 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  26.59 
 
 
352 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  26.44 
 
 
371 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  27.17 
 
 
333 aa  91.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  26.74 
 
 
768 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  26.09 
 
 
333 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  26.93 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>