272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2351 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
393 aa  814    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  55.59 
 
 
378 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  53.74 
 
 
387 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  44.51 
 
 
390 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  38.11 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  39.47 
 
 
361 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  36.95 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.22 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.12 
 
 
413 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  33.08 
 
 
540 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.82 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  32.82 
 
 
540 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.08 
 
 
540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.08 
 
 
540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.08 
 
 
540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.08 
 
 
540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  36.79 
 
 
419 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  34.16 
 
 
458 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  32.87 
 
 
453 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  33.52 
 
 
448 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  32.42 
 
 
449 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.08 
 
 
543 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  33.1 
 
 
451 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.15 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  33.06 
 
 
448 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  33.16 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 
436 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 
461 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 
461 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 
465 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  31.25 
 
 
446 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.24 
 
 
433 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.71 
 
 
446 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  30.26 
 
 
454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  32.8 
 
 
455 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  31.33 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.67 
 
 
525 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  30.35 
 
 
480 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.71 
 
 
433 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.88 
 
 
463 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  32.41 
 
 
491 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.88 
 
 
463 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  31.72 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  33.53 
 
 
311 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  33.24 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  31.02 
 
 
428 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  32.62 
 
 
471 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  32.52 
 
 
461 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  30.32 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  32.15 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  29.57 
 
 
536 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  32.35 
 
 
467 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  33.24 
 
 
469 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  32.98 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.51 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.35 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.35 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.35 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  32.09 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.35 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  28.26 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.08 
 
 
626 aa  132  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  29.76 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  29.76 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  29.76 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  28.67 
 
 
449 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.98 
 
 
461 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  30.56 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  29.47 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  33.24 
 
 
768 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  30.67 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  29.6 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  31.44 
 
 
435 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  31.56 
 
 
397 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  28.78 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  30.19 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  29.4 
 
 
473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  29.4 
 
 
473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  31.17 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  30.52 
 
 
306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  31.17 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  31.17 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.44 
 
 
462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  28.89 
 
 
472 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  31.65 
 
 
464 aa  126  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  31.52 
 
 
459 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  31.64 
 
 
594 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  31.52 
 
 
459 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  31.52 
 
 
459 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  29.62 
 
 
473 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  30.61 
 
 
437 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  32.74 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.02 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.7 
 
 
476 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.35 
 
 
451 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  31.47 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  31.5 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
607 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  31.09 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>